1.腎臟及尿路疾病
（1）炎癥 急慢性腎小球腎炎、急慢性腎盂腎炎、急性膀胱炎、尿道炎、泌尿系統結核、泌尿系統黴菌感染等。
（2）結石 腎盂、輸尿管、膀胱、尿道，任何部位結石，當結石移動時劃破尿路上皮，既容易引起血尿亦容易繼發感染。大塊結石可引起尿路梗阻甚至引起腎功能損害。
（3）腫瘤 泌尿系統任何部位的惡性腫瘤或鄰近器官的惡性腫瘤侵及泌尿道時均可引起血尿。
（4）外傷 是指暴力傷及泌尿系統。
（5）先天畸形 多囊腎，先天性腎小球基底膜超薄，腎炎，胡桃夾現象（該病是血管先天畸形引起走行於腹主動脈和腸系膜上動脈之間的左腎靜脈受擠壓，引起頑固性鏡下血尿。右腎靜脈徑直註入下腔靜脈，而左腎靜脈須穿過腹主動脈與腸系膜上動脈所形成的夾角註入下腔靜脈。正常時此角45°～60°，若先天性此角過小或被腸系膜脂肪、腫大淋巴結、腹膜充填均可引起胡桃夾現象。診斷主要靠CT、B超、腎靜脈造影檢查。治療須手術矯正）。
2.全身性疾病
（1）出血性疾病 血小板減少性紫癜、過敏性紫癜、血友病、白血病、惡性組織細胞病、再生障礙性貧血等。
（2）結締組織病 系統性紅斑狼瘡、皮肌炎、結節性多動脈炎、硬皮病等。
（3）感染性疾患 鉤端螺旋體病、流行性出血熱、絲蟲病、感染性細菌性心內膜炎、猩紅熱等。
（4）心血管疾病 充血性心力衰竭、腎栓塞、腎靜脈血栓形成。
（5）內分泌代謝疾病 痛風腎、糖尿病腎病、甲狀旁腺功能亢進癥。
（6）物理化學因素 如食物過敏、放射線照射、藥物（如磺胺、酚、汞、鉛、砷中毒，大量輸註甘露醇、甘油等）、毒物、運動後等。
3.鄰近器官疾病
子宮、陰道或直腸的腫瘤侵及尿路。