(1)DNA分子是由兩條反向的平行多核苷酸鏈構成的，壹條鏈的5'-末端與另壹條鏈的3'-末端相對。兩條鏈的糖-磷酸主鏈都是右手螺旋，有壹***同的螺旋軸，螺旋表面有大溝和小溝。
(2)兩條鏈上的堿基均在主鏈內側，壹條鏈上的A壹定與另壹條鏈上的T配對，G壹定與C配對。
(3)成對堿基大致處於同壹平面，該平面與螺旋軸基本垂直。相鄰堿基對平面間的距離為0.34nm，雙螺旋每旋轉壹周有10對堿基，螺旋直徑為2nm。
大多數天然DNA屬雙鏈結構，某些病毒如Фx174和M13的DNA是單鏈DNA分子。