吃菠蘿造成口腔刺痛，最主要的原因是菠蘿中含有高活性的菠蘿蛋白酶等物質，這些物質可以分解口腔黏膜、舌頭、食道內的蛋白質。對胃酸少的人來說，吃菠蘿甚至可能對消化道黏膜造成傷害。菠蘿蛋白酶歸根結底是壹種存在活性的蛋白質，能使蛋白質變性的條件有強酸、強堿、高溫、金屬離子、重金屬鹽等等。這裏面的確提了“鹽”，但要註意是指重金屬鹽，並不是生活中的食鹽。
食鹽（氯化鈉，NaCl）中的鈉離子相當穩定，幾乎不會發生任何化學變化。
所以，用鹽水浸泡菠蘿，並不會使“蜇嘴兇手”菠蘿蛋白酶失活，從而保護口腔不被其刺激。但用鹽水來泡壹下菠蘿，可以部分抑制蛋白酶的活性，所以刺痛感會輕壹些，對食道和胃也更加友好。同時鹽水掩蓋了菠蘿本身的酸味和苦味兒，改善其口感，讓菠蘿的味道更加甜美。如果想在吃菠蘿時徹底排除“刺痛”隱患，就得找準菠蘿蛋白酶的“要害”了。
菠蘿蛋白酶最喜歡的pH環境在6.5-7.5之間，在7.1附近達到活性的最大值，在酸性環境中，酶反應速度下降快，所以用醋來泡菠蘿，是可以“消滅”菠蘿蛋白酶的，當然菠蘿會變得比較“酸爽”。
另外，菠蘿蛋白酶最適宜溫度介於55℃-60℃之間，溫度升高，酶的熱失活性增強，反應速度下降。所以可以把菠蘿在60°以上的溫度下加熱，破壞菠蘿蛋白酶的活性。最好的“無痛”吃菠蘿方式之壹，就是用微波爐對付它。把菠蘿切成小塊，放在微波爐裏高火轉壹兩分鐘，滅活菠蘿蛋白酶的同時，也不會改變菠蘿的風味。然後再拿出來晾涼之後，就可以盡情享用了。