區別如下：
1、花椒顏色為綠色（青花椒）和暗紅色。香味比麻椒濃烈，但是麻味比麻椒低。
2、主要產在西北，如“大紅袍”，四川花椒又以漢源花椒為上，中國大多數地方習慣用花椒，川菜中也廣為運用。
3、藤椒又名竹葉花椒，由於其枝葉披散，延長狀若藤蔓，故稱藤椒。
4、藤椒在樹上結的籽是像葡萄壹樣壹串壹串的，而花椒在樹上結的籽是壹攥壹攥的。藤椒的刺激比花椒和麻椒要小，所以藤椒在用量上相比花椒和麻椒可以多用，熬湯很適合。
5、藤椒的香味比花椒清香，麻味較花椒柔和清新，不刺激，沒有青花椒等苦澀味。
參考資料：
藤椒-百度百科?
花椒-百度百科