1、用途不同：萬金油有芳香通竅、祛風止癢、清涼辟穢、提神醒腦等功效，可用於緩解中暑、暈車、蚊蟲叮咬、頭痛等不適癥狀，清涼油也可用於緩解不適癥狀，不能長時間使用，以免對皮膚造成刺激，引起皮膚瘙癢、發紅等不適癥狀。
2、成分不同：萬金油的主要成分是樟腦、薄荷油、案葉油和桂皮等，清涼油的主要成分是薄荷腦、樟腦、案葉油等。