菊粉是由果糖經β－1，2連接而成的線性直鏈多糖，末端常帶有壹個葡萄糖，聚合度DP通常為2～60之間，菊粉實際上也是多種不同聚合度果聚糖的混合物。聚合度較低（DP＝2～9）的果聚糖通常稱為低聚果糖，聚合度10～30的果聚糖通常稱為多聚果糖。工業化生產的菊粉主要是從菊苣中提取並精制得到，而低聚果糖是以菊粉為原料，經酸解或菊粉內切酶的酶解而生成。