肝上長血管瘤的原因主要有以下幾種：
1、先天性的發育異常，肝血管瘤的發生是先天性肝臟末梢血管畸形所導致。在胚胎的發育過程中由於肝血管發育異常，引起血管內皮細胞異常增生，可以形成肝血管瘤。
2、激素刺激學說，也就是認為肝上長血管瘤和激素刺激有關系，女性在青春期懷孕口服避孕藥，可以使血管瘤的生長速度加快，所以認為女性激素可能是血管瘤的壹種致病因素。
3、其他原因，比如說毛細血管組織感染後變形，導致毛細血管擴張，肝組織局部壞死後血管擴張形成空泡狀體，其周圍血管充血擴張，肝內區域性體循環停滯，致使血管形成海綿的擴張。