成分不同：阿維菌素是16元大環內酯化合物，伊維菌素則是半合成大環內酯多組份抗生素。
功效不同：阿維菌素是壹種被廣泛使用的農用或者是獸用殺蟲剎、殺蟎剎。伊維菌素是新型的廣譜、高效、低毒抗生素類抗寄生蟲藥，對體內外寄生蟲特別是線蟲和節肢動物均有良好驅殺作用，但對絳蟲、吸蟲及原生動物無效。