在中藥學這個學科，上海中醫藥大學和黑龍江中醫藥大學兩所地方高校並列A+。
學科評估是學位中心以第三方方式開展的非行政性、服務性評估項目，2002年首次開展，截至2017年完成了四輪。
學科評估的舉措：
1、強化人才培養中心地位，如加強在學質量與畢業質量相結合的學生質量評價：在學質量突出學生“德智體美勞”全方位代表性成果，註重學生參與度和貢獻度；畢業質量堅持整體就業質量和職業發展質量相結合，註重用人單位評價。
2、堅決破除“五唯”頑疾，如評價教師不唯學歷和職稱，不設置人才“帽子”指標，避免片面以學術頭銜評價學術水平的做法。評價科研水平不唯論文和獎項，設置“代表性學術著作”“專利轉化”“新藥研發”等指標，進行多維度科研成效評價。