艱難梭菌是壹種革蘭氏陽性、厭氧、產芽孢、產毒素的細菌，2016正式更名為艱難梭菌。新名稱反映了該物種與梭菌屬其他成員之間的分類學差異。艱難梭菌的孢子通過糞便途徑傳播，致病菌廣泛存在於環境中。艱難梭菌的潛在宿主包括無癥狀攜帶者、感染患者、汙染環境和動物腸道(狗、貓、豬和家禽)。
約5%的成人和15-70%的嬰兒被艱難梭菌定殖，住院患者或養老院居民的定殖患病率高出數倍。艱難梭菌由Hall和O'Toole於1935年首次從健康新生兒的糞便中分離出來。直到20世紀70年代，它被認為是壹種罕見的微生物，但它存在於正常的腸道微生物區系中。抗生素應用後，艱難梭菌在結直腸疾病發病中的作用增強。在1974中，Tedesco等發現21%的克林黴素治療患者出現腹瀉。進壹步內鏡檢查，50%病例發現假膜。20世紀末，艱難梭菌感染(CDI)的發病率顯著增加。目前，CDI已成為最重要的醫院感染疾病之壹，影響所有病房。