國家重點保護的野生藥材物種分為三級管理：①壹級保護的野生藥材物種是指瀕臨滅絕狀態的稀有珍貴野生藥材物種，包括4種中藥材：虎骨、豹骨、羚羊角、鹿茸（梅花鹿）。②二級保護的野生藥材物種是指分布區域縮小、資源處於衰竭狀態的重要野生藥材物種，包括17種中藥材：鹿茸（馬鹿）、麝香、熊膽、穿山甲、蟾酥、哈蟆油、金錢白花蛇、烏梢蛇、蘄蛇、蛤蚧、甘草、黃連、人參、杜仲、厚樸、黃柏、血竭。③三級保護的野生藥材物種是指資源嚴重減少的主要常用野生藥材物種，包括22種中藥材：川貝母、伊貝母、刺五加、黃芩、天冬、豬苓、龍膽、防風、遠誌、胡黃連、肉蓯蓉、秦艽、細辛、紫草、五味子、蔓荊子、訶子、山茱萸、石斛、阿魏、連翹、羌活。