1，不良反應:口服不良反應較少，壹般較輕，偶有惡心、嘔吐、皮疹及藥物熱，停藥後癥狀壹般消失；
2、禁忌癥:溶血性貧血和葡萄糖-6-磷酸脫氫酶缺乏患者禁用，否則可能導致溶血等不良反應。此外，懷孕前三個月的患者需謹慎，建議服用過量或出現嚴重不良反應時及時就醫；
3.藥物相互作用:對於含鞣質的中藥，由於鞣質屬於生物堿的沈澱劑，可能與黃連素反應生成難溶的鞣質，從而影響藥物的療效。因此，黃連素與其他藥物合用時需要小心，避免藥物相互作用。