目前國家中醫藥管理局重點學科建設項目1個:中醫痹證；國家中醫藥管理局十壹五規劃三個重點專科(專病)建設項目:風濕病學、肝病學、骨質疏松癥；兩個省的中醫重點學科:風濕免疫中西醫結合、骨科中西醫結合；5省中醫重點專科建設項目:腫瘤康復、骨質疏松、骨關節病、肝病、男科。醫院是衛生部骨質疏松癥診療技術合作基地，浙江省中醫住院醫師規範化培訓基地，尿石癥防治研究基地。中西醫結合骨科學與男科學科是浙江省中醫優勢學科培養基地。醫院承擔國家科研項目6項，省部級項目14項，局級項目120多項，院級項目45項，獲得科技成果獎21項，國家實用發明專利14項。
醫院設有浙江省名中醫館分館，邀請國家級、省級名老中醫定期坐診，弘揚中醫造福百姓；積極開展“治未病”工作，推廣冬病夏治、膏方調理、中藥熏蒸、中藥護理等適宜技術；排石操、五禽戲、頸椎操、足療等中醫行之有效的保健方法被帶入鄉村醫院、社區和家庭，受到基層醫生和居民的歡迎。
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