華佗精通內科、外科、婦科、兒科和針灸，尤其擅長外科。他壹生只寫了壹本醫學著作《清囊術》，記錄了他壹生的心血，都是他多年行醫積累的經驗。後來因為不肯被曹操征召而被殺，而這本醫書也被他自己燒掉了，已經失傳。
華佗發明麻飛散，開創了世界麻醉藥品的先河。歐美對全身麻醉手術的記載始於18世紀初，比華佗晚了1600多年。