西醫目前運用較廣的支原體感染治療，可用的藥物有三大類，而首選藥物是大環內酯類，其次是莫西沙星等氟喹諾酮類藥物，再加上女性的感染部位的構造較為特殊，還需輔助以壹定的外用抗菌藥物來進行壹個對婦科支原體感染的治療，但是西藥的副作用也特別大，會使患者產生抗藥性，導致藥效越來越差，不能起到壹個徹底根治的效果。
二、中藥治療
對支原體感染治療上，中藥婦炎丸治療更有優勢。中醫具有無副作用、不易復發、不會產生抗藥性的優勢，主要是采用清熱解毒的藥物，然後根據患者表現出來的癥狀，再配合壹些活血化瘀和健脾利濕、清熱解毒的藥物，進行對癥治療。
治療期間要註意衛生，每天要用溫水清洗自己的私處，勤換內衣褲，並將自己的內衣褲及毛巾、浴巾、面盆等生活用品用高溫殺菌。