重點是運用現代科學技術並結合臨床及藥材生產開展工作，在中藥資源的普查、開發和保護，中藥炮制和制劑研究，中藥藥理學、 藥物化學研究等方面均取得重大進展。據統計，已經鑒定而有學名的中藥品種達5000種以上。在此基礎上， 編寫出版了《中藥誌》、《全國中草藥匯編》、《中藥大辭典》等中藥學巨著。通過本草考證、分類學研究，化學和組織學鑒定等，基本上弄清了800余種常用中藥的動植物資源,澄清了900余個混亂品種，積累了500余種藥材的組織結構特征,初步做到正本清源,保證了臨床用藥的準確性。
在中藥材的人工培植和飼養研究方面，已有150余種野生植物藥材成功地進行了人工栽培，通過對藥用動物的飼養研究，已實現人工養鹿取茸、人工養麝取香。以往靠進口的60種南藥，也已成功地引進 20種。
全國已對500多種常用中藥的不同炮制技術和各地現行的炮制經驗進行了全面系統的整理。通過對傳統炮制工藝的改進研究，提出了“真空加溫軟化”、“少泡多悶”、“熱壓”、“冷壓浸潤”、“減壓冷浸”和“酶處理”等方法，減少了有效成分的損失，提高了飲片質量。通過對中藥炮制前後化學成分和藥理作用改變的深入研究，初步闡明了藥物經過炮制處理而制毒、增強療效的機理，也為中藥炮制工藝的改進、建立中藥飲片質量標準提供了科學依據。
在新劑型研究方面，除了丸、 散、 膏、丹、酒、露、茶等制劑外，新發展了膠囊、口服安瓿、袋泡、氣霧、乳劑、註射、含服液、膜、滴丸、栓劑等40余種劑型。
在中藥藥理學、中藥化學研究方面，已對150余種常用中藥進行研究，從中分離出活性單體500余種，發現壹批活性強的新結構成分，如青蒿素、棉酚、鶴草酚、靛玉紅、丹參酮、聯苯雙脂等。其中，從中藥青蒿中提取的青蒿素，是抗瘧藥物史上繼喹啉類藥物後的壹項重大突破，它對抗喹啉型瘧疾、腦型瘧疾的治療已達到國際先進水平。按國際標準進行研究的青蒿素栓、註射用青蒿琥酯、蒿甲醚註射液，具有高效、速效、低毒、與氯喹無交叉抗藥性以及使用方便的特點。作為壹類新藥已分別於1986和1987年通過國家新藥審批，其臨床研究達到了世界衛生組織 (WHO)對抗瘧新藥的臨床研究技術要求。
自1956年以來，圍繞著常見病、多發病、難治性疾病的臨床需要廣泛開展了對中藥復方的藥效學實驗研究，所涉及的方劑已有650多個。運用同位素、電子顯微鏡、生物化學、免疫、細胞培養等技術，從整體、器官、組織乃至細胞、亞細胞和分子水平探討和闡明了生脈散等壹批復方的作用原理。通過補中益氣湯、正柴胡飲等方劑的拆方和配伍研究，在壹定程度上說明了藥物間的 “七情”和 “調動”作用，初步揭示了方劑組成的嚴謹性和科學性。復方研究推動了中成藥生產的發展，目前經常供應市場的中成藥品種已達4000余種。