後代記載了應用磁鐵治療疾病。比如東漢的《神農本草》(約公元2世紀)中，就說用寒溫的仁(磁)石治療風濕、關節痛、發熱、耳聾等疾病。南北朝陶弘景(公元510年)寫的醫書《名醫錄》中說，磁石可以補腎壯脊，疏通關節，消腫止痛。唐代著名醫學家孫思邈在《錢進方》(公元652年)中也談到用磁鐵制成的蜜丸，經常服用可以明目。北宋何希英的《盛慧芳》(公元1046年)壹書中也提到，磁石可以治小兒誤吞針頭，即把壹塊棗核大的磁石打磨後放入咽喉，再把誤吞的針頭吸出來。南宋時期嚴格使用的醫書《方繼生》(公元1253年)也談到了用磁鐵治療聽力不好的耳疾。這是用新棉花在耳朵裏放壹個豆粒大小的磁鐵，然後在嘴裏放壹個生鐵，改善病耳的聽力。明代著名藥劑師李時珍所著的《本草綱目》對醫用磁石有著豐富而總結性的描述。它詳細描述了磁鐵的形狀，主要治療的名稱，藥物的制備方法和各種應用。例如，磁鐵治療的疾病包括腎虛耳聾、老年人耳聾、老年人體弱、失明白內障、兒童癲癇、子宮衰竭、大腸脫肛、腸膿腫、膿腫出血等。磁石制成的藥物有磁朱丸、紫雪散、耳聾左慈丸等。
總的來說，各個朝代的醫書上往往都有用磁鐵治療多種疾病的記載。
中國1921出版的《中國醫學大辭典》(謝冠主編)記載了幾種以磁石為重要原料的中成藥，如磁石丸、磁石丸、磁石發、磁石羊腎丸、磁石酒、磁石粉、磁石珠丸等。1935初版，1956修訂的《中國藥學大辭典》詳細記載了磁石的種類、制法、用法、適應癥及歷代記載，列舉了磁石在醫學上的應用10多種。在衛生部1963出版的《中華人民共和國藥典》中，列舉了幾種以磁石為重要成分的中成藥，如二龍左慈丸、紫雪散、磁朱丸等。
磁學在生物學和醫學上的壹個重要應用是核磁共振成像(MRI)，也稱為核磁共振CT(CT是計算機斷層掃描的縮寫)。這是壹種核核素，即利用核磁共振的方法和電子計算機的處理技術得到的這種核素的化學元素的濃度分布圖像。
核磁共振成像技術的基本原理是:原子核帶正電，自旋。通常情況下，核自旋軸的排列是不規則的，但當將其置於外磁場中時，核自旋的空間取向從無序變為有序。自旋系統的磁化矢量從零開始逐漸增大，當系統達到平衡時，磁化達到壹個穩定值。如果此時核自旋系統受到外力作用，比如壹定頻率的射頻激發核，就可以引起* * *振動效應。射頻脈沖停止後，已經被自旋系統激發的原子核無法維持這種狀態，會在磁場中回到原來的排列狀態，同時釋放微弱的能量成為無線電信號。這些信號被探測和空間分辨，並獲得運動核的分布圖像。核磁共振振動的特點是流動的液體不產生信號，稱為流動效應或流動空白效應。
所以血管是灰白色的管狀結構，而血液是黑色的，沒有信號。這使得血管很容易被軟組織分開。正常脊髓被腦脊液包圍，腦脊液呈黑色，有脂肪襯托的白色硬腦膜，使脊髓呈現白色強信號結構。核磁共振(NMR)振動已經應用於全身各種系統的成像診斷。最好的結果是大腦及其脊髓、心臟血管、關節骨、軟組織和盆腔。對於心血管疾病，不僅可以觀察各種心腔、大血管和瓣膜的解剖變化，還可以進行心室分析，進行定性和半定量診斷，制作多個高空間分辨率的斷層視圖，顯示心臟和病變的全貌及其與周圍結構的關系。
目前使用的是氫的核磁共振斷層成像。這種斷層掃描比X射線斷層掃描(也稱為X射線CT)更有優勢。例如，X射線斷層成像是成像對象的密度分布圖像，而核磁共振斷層成像是成像對象的核密度的分布圖像。目前雖然只局限於氫核的密度分布圖像，但氫是構成人體和生物體的主要化學元素。因此，從核磁共振斷層成像獲得的氫元素分布圖像比從X射線密度分布圖像獲得的更多關於人體和有機體的信息。例如，人的頭部外顱骨密度高，而內部腦組織密度低，因此很難從人的頭部X射線斷層成像中獲得清晰的人腦組織圖像。但是從人體頭部的核磁共振斷層成像中，我們可以清楚地看到頭部腦組織中氫核的分布情況，從而可以看出腦組織是否正常。再比如，當初始腫瘤患者與正常組織無明顯差異時，從X線斷層掃描看不出異常，但從核磁共振斷層掃描可以看出異常。腦瘤可以用磁共振斷層掃描檢查出來，但不能用x光斷層掃描檢查出來。目前核磁共振斷層成像雖然只使用了壹種核元素氫核，但是可以預測會有更多的核元素出現，比如碳核和氮核，核磁共振斷層成像也會進入應用。
磁學不僅可以診斷，還可以幫助治療疾病。磁鐵在中國古代醫學中是盲目使用的。現在人們利用血液中不同成分的磁性差異來分離紅細胞和白細胞。此外，磁場與人體經絡的相互作用可以實現磁療，對治療多種疾病有獨特的作用，已應用於磁療枕、磁療帶等。