1、中藥治療：應以健脾補腎、益氣除濕為治本之法，清熱解毒，活血化瘀為治標之用，辨證施治，最忌長期應用大苦大寒之劑，亦可配合中藥針如麥註參麥註射液、黃芪註射液等靜滴以扶正。
2、西藥治療：根據患者具體情況，如炎癥明顯時可短期使用抗生素，配合口服麗珠腸樂、得舒特等藥物調節腸道功能。
3、中西藥結合灌腸：采用獨有中藥配方“腸炎I號方”配合西藥研粉混合保留灌腸，經臨床驗證療效滿意。
4、心理治療：該病患者常有焦慮、憂郁、緊張、多疑等精神心理改變，嚴重者可予抗抑郁治療。
5、其它治療：如①營養飲食治療：可予高營養、低脂、少渣易消化飲食，或囑患者可予山藥、白扁豆、苡米等煮粥，常食健脾養胃；②高壓氧治療：對潰瘍性結腸炎患者療效尢佳。
水針療法降服慢性結腸炎，中醫水針療法是根據中醫臟腑經絡學說，將針刺與藥物相結合的壹種全新療法，即針對患者的不同病情，將有效藥物通過穴位皮下註射註入相關穴位，使局部產生酸、麻、脹的感覺。其主要特點是見效較快，療效確切，不易復發。其機理是通過針刺的機械作用、藥物的藥理作用以及穴位開闔與傳導作用，三者有機地結合起來，對機體產生強烈刺激，從而達到恢復腸道正常功能，使病竈愈合的目的。
參考資料：
慢性結腸炎的食療藥膳
（1）飲食治療：
腹瀉期要註意補充營養，適當減少飲食中纖維素成分，以易消化富含葉酸、鐵、鈣、鎂、鋅等微量元素的流質飲食為宜。避免牛奶及乳制品。嚴重者最初幾天宜禁食，可用靜脈高營養治療，使腸道得到休息。
（2）心理治療：
做好患者思想工作，盡量全身放松，精神過度緊張者，可用鎮靜劑如安定、舒樂安定等。
（3）食療：
①健脾止瀉糕：
鮮山藥250克、赤小豆150克，芡實米30克、白扁豆20克、茯苓20克、烏梅4枚、果料及白糖適量。制法：赤小豆成豆沙加適量白糖。茯苓、白扁豆、芡實米***研成細末、加少量水蒸熟。鮮山藥去皮蒸熟加入上粉，拌勻成泥狀，在盤中壹層鮮山藥粉末泥，壹層豆沙，約6-7層，上層點綴適量果料，上鍋再蒸。烏梅、白糖熬成膿汁，澆在蒸熟的糕上。分食之有健脾止瀉之功。
②百合粥：
芡實、百合各60克。上兩味藥放入米粥內同煮成粥，主治脾虛泄瀉。
③紫莧菜粥：
紫莧菜100克，白米50克，先用水煮莧菜，取汁去滓，用汁煮米成粥，晨起做早餐服之。
④銀花紅糖茶：
銀花30克，紅糖適量，泡水飲用。
⑤石榴皮紅糖茶：
石榴皮1-2個，紅糖適量，泡水飲用。
⑥車前草60克，竈心土60克，生姜3克，水煎服。
慢性結腸炎常用西藥
（1）柳氮磺胺吡碇（SASP）：
[作用與用途]本藥在腸道內分解為5-氨基水楊酸（5-ASA）與碘胺吡碇，前者是主要有效成分，能抑制黃嘌呤氧化酶或白細胞介導的氧自由基形成，能消除炎癥。
[用法和劑量]口服：發作期1克/次，3-4次/日，病情緩解後為0.5-1克，2-3次/日，維持治療1年。保留灌腸：以粉劑2.0克加白芨3.0克，溶於生理鹽水。20-30ml中，均勻混搖後進行灌腸，每日1次。
[不良反應和註意事項]偶有胃腸道癥狀，皮疹等變態反應。
（2）甲硝唑：
[作用與用途]主要用於各種厭氧菌感染、阿米巴病及絲蟲病等。
[用法和劑量]口服，成人每次0.4克，每日3-4次，用15日為1療程。靜滴：成人每次0.5-1.0克，分2次。
[不良反應和註意事項]
①胃腸道癥狀最為常見，與劑量呈正相關。
②肝病患者慎用。
③偶見頭暈、感覺異常、肢麻、***濟失調，停藥即可緩解。
④個別患者可有白細胞減少。
（3）激素類（具體藥物有：氫化可的松、強的松、地塞米松等）：
[作用與用途]此類藥物可減少白三烯B4的釋出，抑制其中性粒細胞的趨化作用，防止氧自由基的形成。
[用法和劑量]靜滴：200-300毫克/日，維持10-14天。後改用口服強的松60-80毫克/日，病情穩定後逐漸減量至10-15毫克/日，維持半年左右然後停藥。病變主要局限於直腸、左側結腸的患者，可用半琥珀酸鈉氫化可的松100毫克、21-磷酸潑尼松龍20毫克或地塞米松5毫克加生理鹽水100ml，作保留灌腸，1次/日，病情好轉後改為2-3次/周，療程1-3個月。
[不良反應和註意事項]對合並感染者不宜應用，有糖尿病、高血壓、潰瘍病活動期及腎功能不全者禁用。
（4）硫唑嘌呤
[作用與用途]此類藥物在體內產生硫嘌呤而發揮免疫抑制作用，抑制蛋白質的合成和淋巴細胞的增殖，對T淋巴細胞的抑制作用較強。
[用法和劑量]每日1.5-2.5毫克/千克，分3次口服；療程約1年。
[不良反應和註意事項]與劑量有關，有骨髓抑制、白細胞減少、粒細胞減少等作用，有惡心、嘔吐、少數有肝臟毒性；有致畸危險。
參考資料：