1998，楊紫茳醫藥集團在江蘇醫藥行業率先建立博士後研究中心。2001年，楊紫茳藥物研究所被原國家經貿委等部門認定為國家級企業技術中心。2006年，楊紫茳藥物研究所被科技部認定為國家級企業創新研究中心。2006年，集團整合了楊紫茳醫藥研究院下屬R&D中心的資源，組建了化學藥物R&D中心、藥物制劑技術工程研究中心、生物藥物R&D中心和中藥制造技術工程研究中心四個R&D中心。基於此，江蘇省(泰州)新藥研究院成立，致力於化學藥物、中成藥、生物藥物及制劑技術的創新研發。同年，江蘇(泰州)新藥研究院被江蘇省委、省政府和江蘇省科技廳列為江蘇省“十壹五”期間R&D重點事業單位項目。
化學藥物研發技術中心
從事抗病毒藥物、內分泌藥物、心腦血管藥物三大領域原料藥的設計、合成、篩選技術研究、產品開發、中試及產業化。目前，該項目已被列入國家發改委技術中心創新能力建設專項。
中藥制造工藝工程研究中心
從事大孔吸附樹脂技術、膜分離技術、超臨界萃取技術、超微粉碎技術在中藥制造過程中的應用研究、產品開發及產業化研究。該項目已被列為國家發改委工程中心建設項目，並已通過驗收。項目名稱為南京海陵中藥制藥技術國家工程研究中心。
藥物制劑技術工程研究中心
從事難溶性藥物脂質體技術、緩控釋制劑技術、藥用乳劑技術、中藥膠囊防潮輔料技術的應用研究、產品開發及產業化研究。該項目被批準為第壹批企業國家重點實驗室，項目名稱為藥物制劑新技術企業國家重點實驗室。
生物醫學研究與發展技術中心
從事生物診斷試劑研發技術、單克隆抗體研發技術的應用研究、產品開發和產業化研究。