該中心的方向和任務是結合國家新藥研發的需要，以生物體內微量藥物成分的分析技術為重點，研究開發藥物分析的新技術和新方法，主要包括:藥物代謝轉化研究、體液中原型藥物和代謝物的分析方法研究、中草藥有效成分的分離、結構鑒定和分析、新藥質量控制研究、現代儀器測定藥物有效成分的結構等。
中心主任由中國科學院分析化學家周同輝教授擔任，現有科技人員36人，其中高級職稱17人(其中研究員12人)，中級職稱9人，初級職稱9人。
中心擁有的主要實驗設備和大型精密儀器有:高效液相色譜儀、氣相色譜儀(日本島津GC-9A)、薄層掃描儀(日本島津CS-930)、庫侖滴定儀、微量元素分析儀(意大利卡洛-巴爾公司1106)、氣相色譜儀(美國VG公司MD800)。毛細管電泳儀(美國貝克曼公司的P/ACE 5500)、紫外-可見分光光度計(日本島津公司的UV-3000)、傅裏葉紅外光譜儀(美國尼科萊特公司的IMPACT-400)、500 MHz核磁共振* *振動器(瑞士布魯克公司的AM-500)、300 MHz核磁共振* *振動器(美國瓦裏安公司的Mercury-300型)、高分辨率質譜儀(英國VG公司的ZAB-2F)、X射線四園衍射儀(R3
中心於1997通過計量認證，獲得中華人民共和國計量認證證書[(97)計量認可(中國)字(Z1667)]和國家技術監督局頒發的計量認證證書。通過計量認證的有九項:
1.中草藥和中成藥的成分分析:
中草藥中生物堿、苷類、黃酮類和揮發油的分離、結構鑒定、分析和測定。
2.藥品質量測試:
化學合成藥物及其制劑、中藥及其制劑臨床應用質量標準的復核與制定。
3.藥物代謝轉化和代謝物分析:
正在開發的新藥(化學合成藥物和從天然產物中提取的單體)的代謝轉化和代謝物分析。
4.藥代動力學測試:
從化學合成藥物和正在開發的天然產物中提取單體的代謝動力學試驗(暫不包括放射性核素示蹤法)。
5.有機化合物的元素分析:
測定藥物和有機化合物中碳、氫、氮、硫、氟、氯、溴、碘和金屬的百分含量。
6.從藥物和天然產物中提取的單體結構分析:
(1)紅外光譜(IR):測試方法包括KBr片、石蠟糊和液膜。
(2)紫外光譜:從新藥和天然產物中提取的單體的定性和定量測定。
(3)質譜(MS):可以檢索測試結果。
(4)核磁共振譜(NMR):壹維氫譜、碳譜、磷譜及相關二維譜的測試。
7.從藥物、中間體和天然產物中提取的單體的晶體結構分析。
8.藥物和天然產物中氨基酸組成的分析。
9.精子堿性核蛋白的檢測:
測定不育男性患者精子核中組蛋白和精子蛋白的相對含量，是評價精子生育力的重要指標。