GMP主要適用於藥品生產企業，GSP主要適用於藥品經營企業銷售。
1、GMP是針對藥品生產廠家具體生產流程，管理規範，質量控制等壹系列質量管理制度或者體系。GMP認證相當於生產許可或者生產資質，通過認證的企業才能合法的生產藥品。
2、GSP是針對藥品流通環節的管理制度，質量控制體系。涵蓋從生產企業到商業配送公司，到醫院藥房最後到患者，或者從零售藥店到患者的全過程。GSP認證是藥品流通企業的前提，從倉庫管理，物流配送，財務合規等等很多方面，也是現階段SFDA飛檢的重點項目，也是被吊銷最多的。
3、兩者區別：針對藥品的不同階段或者不同環節的管理。對企業來說，要看企業的定位，業務涵蓋流程進行相應的準備和完善。