指甲花粉的染色原理是指甲花粉中含有壹種植物色素，叫三磨花，在60度以上的高溫和100度以上的濕度條件下，慢慢從基粉中解離出來，(特別是在酸性環境下，能加快其解離速度)，與頭發中的角蛋白(主要成分是氨基酸)結合，生成新的著色物質。
這種發色物質在空氣中會明顯加深顏色(這就是指甲花粉染兩三天後頭發會加深的原因)，在陽光下會根據發質和背景顏色的不同形成紅棕色、棕色、咖啡色等顏色。
擴展數據:
損害
浙江潘新美國食品藥品監督管理局表示，美國食品藥品監督管理局和衛生部從未批準化妝品含有指甲花，即指甲花。在2007年衛生部的回復中，也指出指甲花不能作為染發劑的成分。
衛生部有這樣的規定不是沒有道理的。有專家指出，指甲花之所以被禁，是因為其提取物具有誘變作用。早在2001，國外就有權威論文通過動物實驗證明，海娜有可能誘發孕婦自然流產。
如果用量較大，還可能引起頭暈、抽筋、食欲不振、虛弱、短暫性失憶等癥狀。歐盟早前也發表聲明，指甲花對骨髓也有毒性。
參考資料:
百度百科-海娜粉