有時間限制，每年只能報銷當年的不能兩年壹起報銷。
新農合二次報銷又稱新農合大病保險補償：參合農民不需要再交壹分錢，當年按照每人每年15元標準從新農合資金結余中劃撥大病保險基金。農民壹旦犯了大病，將在享受新農合報銷基礎上，對自付費用1萬元以上的合規費用還可享受不低於50%的二次報銷。
新農合大病保險補償標準為：起付線1萬元，***分5個費用段。其中，起付線以上~2萬元（含2萬元）按50%報銷；2萬元以上~5萬元（含5萬元）按60%報銷；5萬元以上~10萬元（含10萬元）按70%報銷；10萬元以上~20萬元（含20萬元）按75%報銷；20萬元以上按80%報銷。轉診到三級以上非定點醫療機構住院、以及外出務工等就醫認定為享受轉外住院政策的，按照上述分段報銷比例的50%報銷；轉診到二級非定點醫療機構住院的，按照上述分段報銷比例的40%報銷；轉診到二級以下非定點醫療機構住院的按照上述分段報銷比例的30%報銷。報銷費用沒有封頂線。