微生物包括細菌、病毒、真菌、壹些小型原生動物、微藻等。它們很小，與人類關系密切。
微生物涵蓋有益和有害的多種，廣泛涉及食品、醫藥、工農業、環保、體育等諸多領域。
在中國大陸和臺灣地區的教科書中，微生物被分為以下八類:細菌、病毒、真菌、放線菌、立克次體、支原體、衣原體和螺旋體。有些微生物是肉眼可見的，比如屬於真菌的蘑菇、靈芝、香菇等。微生物是壹種由核酸、蛋白質等少數成分組成的“非細胞生物”，但其生存必須依賴活細胞。
對微生物形態的觀察始於安東尼·萊文霍克發明的顯微鏡。他用放大50 ~ 300倍的顯微鏡，清晰地看到了細菌和原生動物。他的發現和描述首次揭示了壹個全新的生物世界——微生物世界。在微生物學發展史上具有劃時代的意義。
微生物對人類最重要的影響之壹就是傳染病的流行。人類50%的疾病是由病毒引起的。微生物引發人類疾病的歷史，也是人類與之鬥爭的歷史。在疾病的預防和治療方面已經取得了很大的進展，但是新的和再現的微生物感染繼續發生。
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