六味地黃丸以滋陰補腎為主，藥方較為平和，而知柏地黃丸則重用清火藥物，兼有滋陰清熱的功效。
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2、配料不同
六味地黃丸主料熟地黃、山茱萸（制）、牡丹皮、山藥、茯苓、澤瀉。輔料：黃酒。知柏地黃丸 主要成分：知母、黃柏、熟地黃、生地黃、山藥、鹿茸（制）、白芍、茯苓、澤瀉。輔料為蜂蜜。
3、功效不同
六味地黃丸主治滋陰補腎。用於腎陰虛，頭暈耳鳴，腰膝酸軟，骨蒸潮熱，盜汗遺精。知柏地黃丸用於滋陰清熱。用於發熱盜汗、口幹咽痛、耳鳴遺精、小便短赤。
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