每種經過審批的保健食品在藥監局的查詢系統中都有備案，如果因為某種原因此批號被註銷，藥監局網站也可以查詢到記錄，但會註明”已註銷“以及註銷原因，未標註已註銷的產品且在有效期內的保健食品均可以認為是合法。
另，合法的保健食品還必須符合所有已登記信息，如生產廠家、持有人、配方組分、功能等等。