在藥物治療方面，通常使用抗生素、消炎藥和止瀉藥。選擇藥物時應根據狗狗的實際情況，盡量減少藥物對狗狗身體的不良影響。
抗生素是治療胃腸道疾病的主要藥物之壹，分為廣譜抗生素和特異性抗生素兩種。廣譜抗生素能有效殺滅多種細菌，但同時也會破壞狗狗腸道的微生態平衡，對狗狗的健康造成影響。而特效抗生素則是更好的選擇，因為它們只能選擇性地殺死目標細菌，對狗狗腸道微生態的影響較小。
除了抗生素，消炎藥在腸易激綜合征的治療中也發揮著重要作用。消炎藥可以緩解腸胃炎的癥狀，幫助狗狗恢復健康。但需要註意的是，消炎藥也會影響狗狗腸道的微生態平衡，應在醫生的指導下使用。
如果腸胃炎伴有腹瀉問題，可以加用止瀉藥。但切記只要在醫生的指導下使用，以免用錯藥物產生副作用導致狗狗病情惡化。
總之，在狗狗急性腸胃炎的治療中，藥物是重要的治療手段之壹。但治療過程中需要註意，在醫生的指導下合理用藥，避免造成不必要的傷害。同時，平時要註意狗狗的飲食衛生，預防疾病的發生。