現代化的醫藥物流配送中心，加速了醫藥商品流通，減少醫藥商品損耗，降低了流通成本、提高了庫存周轉率，降低了醫藥系統的采購、驗貨和入庫的費用，減少倉庫面積、節地面積、人力和財力、提高了經營靈活性和工作效率。但是目前我國醫藥物流中心只是處於初級階段。
所謂的醫藥物流就是指：依托壹定的物流設備、技術和物流管理信息系統，有效整合營銷渠道上下遊資源，通過優化藥品供銷配運環節中的驗收、存儲、分揀、配送等作業過程，提高訂單處理能力，降低貨物分揀差錯，縮短庫存及配送時間，減少物流成本，提高服務水平和資金使用效益，實現的自動化、信息化和效益化。醫藥物流不是簡單的藥品進、銷、存或者是藥品配送。