為了防止水華，首先要保持養殖水體適當的透明度，個人經驗應該不低於15cm。當養殖水體透明度過低時，增加水體透明度的最佳方法是減少水體中懸浮的有機物、懸浮顆粒和膠體物質。有機物可被芽孢桿菌分解，而懸浮顆粒和膠體物質可利用凈水靈、黑炭晶或水排毒護水寶快速沈澱；當水體透明度小於40 cm時，此時其養分已不足，應抓住時機快速補肥；其次，保持藻類的多樣性，可以避免單壹藻類引起的藻類倒伏和藻類的世代更替，增加藻類的穩定性，避免藻類倒伏。活褐藻膠、鈣鎂寶、磷肥可分次添加；最後，要保持藻類和微生物的平衡，如投餵精養池塘，每周定時使用壹次孢子粉和幹酪乳桿菌，保持水色穩定。
對於藻類已經倒置的情況，水質渾濁，由於藻類太少導致魚每天缺氧，或者表面有壹層藻類，但表面下藻類很少，需要重新培養藻類。壹是需要補充足夠的氮、磷、鉀、活藻等初級營養物質，對於壹些難以培養藻類的情況，還需要補充碳源、幹燥乳桿菌、鈣鎂寶。根據缺什麽補什麽的原理，藻類只有在缺了什麽的情況下才能培養，也就是說水可以施肥。如果條件允許，還可以通過換水的方式，從附近的魚塘引入富含藻類的地表水，可以快速處理。如果水質黑臭，亞硝酸鹽含量高，應增加磷肥用量，同時結合底肥改性單進行底肥改性。
有壹種特殊情況，就是有機質多，輪蟲多，藻類少，培養出來的藻類不夠輪蟲消耗。因為缺少微生物的分解，水質往往又白又渾，總是不肥。這時候可以用輪環把輪蟲打死，壹袋用兩畝。殺死輪蟲後，再加入芽孢桿菌原粉、幹酪乳桿菌、活藻培養水。