壹、新農合報銷比例
1、原則上規定，參合農民每人每年補償標準最高不超過6000元。參合農民因患大病，當年醫療費數額特大的實行二次補償。二次補償最高限額不超過6000元。即參合農民當年因患大病住院治療，當年可享受最高12000元的補償。少數縣市制定的方案略高於此標準。
2、新農合政策範圍內的住院費用和報銷比例也由60%提高到了70%，最高的支付限額已經從3萬元提高到不低於5萬元。同時各地還將普遍開展新農合的門診統籌，農民門診就醫也可以按照比例來報銷。這個報銷比例是根據醫院等級來的，而不是按照市級或者縣級來的，另外各個省根據當地經濟水平不同，報銷比例也會有5%的差異：
門診報銷比例上調至30%，住院報銷比例壹級醫院不低於75%、二級醫院不低於55%、三級醫院不低於45%，政策範圍內住院實際補償比達到70%，最高封頂線10萬元，達到農民年人均純收入10倍以上。基本藥物、中藥飲片(包括院內中藥制劑)及中醫針灸、推拿、拔罐、刮痧等中醫適宜技術報銷比例提高10%。
3、衛生部會同民政部啟動農村居民重大疾病醫療保障工作，由農村兒童先心病和急性白血病開始，逐步擴大到20種疾病。新農合在限定費用基礎上，將重大疾病的報銷比例提高到70%，對於符合條件的救助對象醫療救助再補償20%。
根據醫改要求，各地將以省(市)為單位全面推開兒童白血病、先心病、終末期腎病、乳腺癌、宮頸癌、重性精神疾病、耐藥肺結核、艾滋病機會性感染等8類重大疾病保障工作，並在1/3左右的統籌地區，將血友病、慢性粒細胞白血病、唇腭裂、肺癌、食道癌、胃癌、I型糖尿病、甲亢、急性心肌梗塞、腦梗死、結腸癌、直腸癌等12類疾病納入農村居民重大疾病保障試點範圍。
二、新農合報銷流程的結報程序
(壹)在縣內定點醫療機構門診就診的醫藥費在就診醫療機構刷卡報銷。定點醫療機構要每月匯總並及時填報《新型農村合作醫療門診醫藥費報銷壹覽表》和《新型農村合作醫療門診醫藥費申請核撥表》，向縣農醫辦辦理費用審核撥付手續。
(二)在縣內定點醫療機構住院診治，可以享受新型農村合作醫療資金報銷的部分費用，在辦理出院手續時，由就診定點醫療機構刷卡報銷。定點醫療機構要每月匯總並及時填報《新型農村合作醫療住院費用壹覽表》和《新型農村合作醫療住院費用申請核撥表》，向縣農醫辦辦理費用審核撥付手續。
(三)在縣外醫保定點醫療機構門診、住院診治，先由參合人員墊付壹切費用，醫療終結後，持定點醫療單位的有效票據、匯總清單、病歷卡、新型農村合作醫療卡及身份證復印件，到所在地鄉鎮農醫辦申報，由鄉鎮農醫辦上報縣農醫辦進行審核報銷。
(四)特殊病種(惡性腫瘤、結核病、精神病、再生障礙性貧血、慢性腎功能衰竭透析、系統性紅斑狼瘡、血友病)在縣內、縣外定點醫療機構門診所發生的醫藥費，先由參合人墊付壹切費用，醫療終結後，持定點醫療單位的有效票據、病歷卡、醫院證明、身份證復印件及新型農村合作醫療卡，到所在地鄉鎮農醫辦申報，由鄉鎮農醫辦上報縣農醫辦按住院報銷辦法給予報銷(病程較長、醫療費較高的，中途視情預報銷)。
(五)已參加商業保險的人員發生的醫療費用，可持商業保險公司的理賠單和有效票據復印件按上述辦法報銷，但兩者報銷總額不得超過實際發生醫療費。
法律依據：
《中華人民***和國社會保險法》
第二十四條 國家建立和完善新型農村合作醫療制度。
新型農村合作醫療的管理辦法，由國務院規定。
第三十條：下列醫療費用不納入基本醫療保險基金支付範圍：
（壹）應當從工傷保險基金中支付的；
（二）應當由第三人負擔的；
（三）應當由公***衛生負擔的；
（四）在境外就醫的。
醫療費用依法應當由第三人負擔，第三人不支付或者無法確定第三人的，由基本醫療保險基金先行支付。基本醫療保險基金先行支付後，有權向第三人追償。
第五十七條：用人單位應當自成立之日起三十日內憑營業執照、登記證書或者單位印章，向當地社會保險經辦機構申請辦理社會保險登記。社會保險經辦機構應當自收到申請之日起十五日內予以審核，發給社會保險登記證件。
用人單位的社會保險登記事項發生變更或者用人單位依法終止的，應當自變更或者終止之日起三十日內，到社會保險經辦機構辦理變更或者註銷社會保險登記。
市場監督管理部門、民政部門和機構編制管理機關應當及時向社會保險經辦機構通報用人單位的成立、終止情況，公安機關應當及時向社會保險經辦機構通報個人的出生、死亡以及戶口登記、遷移、註銷等情況。