在藥品生產中，壇罐和壇瓶用得很多，分別與管道閥門、儀器儀表相連，形成壹個生產單元。對它的消毒，傳統的方法較好的是用酒精浸泡。反應罐、儲存罐小的壹噸半，大的十噸幾十噸，都要裝滿酒精，酒精用量可想而知。消毒完成後，再把酒精放掉，但在邊邊角角、儀表閥門接縫處，會有酒精殘留，要清除這些殘留酒精，要用氮氣吹，直到吹幹為止。酒精量大，消毒時間長，操作過程復雜。高壓蒸汽也存在同樣的問題，都非常費力。
（二）中央空調凈化系統對潔凈區的消毒殺菌
食品廠\化妝品廠\生物制藥廠，壹般來說，潔凈區面積較大，多采用中央空調凈化系統來完成對潔凈區的凈化消毒。傳統的消毒方法是采用甲醛熏蒸，如上所述，甲醛熏蒸的弊端不少，用臭氧消毒來代替不失為壹種好方法。該方法是將臭氧發生器直接安裝在空調凈化系統的風管中，稱為內置臭氧發生器。臭氧隨風管的氣流，送入潔凈區，對潔凈區進行消毒殺菌，剩余的臭氧吸入回風口，由中央空調帶走。臭氧發生器也可以放置在中央空調出風口外，將臭氧導入中央空調風道，再送入潔凈室，稱為外置式臭氧發生器。外置式臭氧發生器易於安裝和維修，但制造成本稍高。兩種方法的消毒效果是壹樣的。
（三）廣州環衛臭氧機對空間消毒滅菌
對於中央空調凈化系統以外的潔凈室，或需要消毒滅菌的其他房間需要單獨消毒滅菌。其方法是選用臭氧發生器，直接安裝在房間內。根據需要設定消毒時間，消毒結束後會自動關閉，使用非常方便。
（四）物品表面消毒殺菌
在食品廠\化妝品廠\生物制藥廠的生產過程中，經常要對原料、用具、包裝等進行表面消毒，常采用消毒櫃、傳遞窗等。傳統的方法是使用紫外線消毒。問題主要出在消毒不徹底，所以如果用在如傳遞窗等要求較高的場合是可以的。但其效果不如臭氧。可制成臭氧發生器的消毒櫃在制藥廠很受歡迎。只要是不怕臭氧腐蝕的東西都可以放在櫃子裏進行消毒。臭氧濃度可以設計得高壹點。可以達到100ppm以上。
（五）水殺菌
在制藥廠用水較多的地方，有制藥用水、消毒用水、清洗用水和飲用水等區別。根據不同的水質要求，采用不同的工藝，消毒工藝壹般用臭氧水處理法就能達到滿意的效果。