負責政務公開工作；負責機關文字綜合、文電、信息、保密、檔案、信訪、安全保衛和行政後勤工作；負責機關日常工作的協調和督辦。
（二）監獄管理處。
監督管理全省監獄（所）獄政管理工作。擬訂監獄管理規章制度並組織實施；負責罪犯移送、分押、分級處遇、獎懲考核和監獄檔案卡管理；負責監獄設施和技術裝備的管理；負責與武警部隊武裝監管的協調；負責監獄（場所）信息化建設。
（3）教育改造處。
監督管理全省監獄（所）教育改造工作。制定教育改造規章制度並組織實施；負責指導罪犯思想、文化、技術教育工作；負責指導現代文明監獄（所）創建工作；負責指導監獄入監教育、出監教育、個別教育、監區文化和社會幫教工作；負責指導罪犯心理矯治工作；監督管理邪教類罪犯的教育轉化工作；負責省級罪犯改造積極分子的審核工作；負責監獄（所）的教育改造和宣傳工作。
（四）刑罰執行處。
監督管理全省監獄（所）刑罰執行工作。擬訂刑罰執行規章制度並組織實施；管理罪犯的收監、釋放工作；承辦死緩、無期徒刑罪犯減刑的審核、報批和有期徒刑、假釋罪犯減刑備案工作；負責保外就醫罪犯的復查和罪犯的代理、控告、檢舉工作；監督刑罰宣傳工作。
（五）生命健康管理處。
監督管理全省監獄（所）的生活衛生管理工作。制定生活衛生管理規章制度並組織實施；監督檢查罪犯體量標準的執行情況；指導罪犯夥食和醫療管理工作；指導監獄醫院醫務人員業務和醫院分級、藥品管理工作；組織協調罪犯疾病預防控制工作。
（六）監獄偵查處。監督管理全省監獄（所）的獄偵工作。擬訂監獄偵查規章制度並組織實施；負責監獄在押罪犯重新犯罪的預防和打擊工作；負責獄情動態的調查研究；指導監督監獄耳目建設、監獄案件偵破、審理和移送工作。
（七）勞動改造管理處。
監督管理全省監獄（所）勞動改造工作。擬訂勞動改造規章制度並組織實施；負責監獄（所）勞動生產項目、勞動加工項目的審核；協調監獄和監獄企業勞動改造工作事項；指導罪犯勞動改造和安全生產工作；協調重大安全事故的處理。
（八）發展規劃處。
擬訂監獄中長期規劃和建設計劃；研究提出監獄投資的有關配套措施；指導、協調監獄建設項目的審查、論證並監督實施；負責直屬單位的統計工作。
（九）財務裝備處。
監督直屬單位財務管理和會計核算，編制年度預算；監督管理直屬單位國有資產保值增值；監督管理監獄（所）物資設備供應，監督直屬單位經費撥付執行情況；按有關規定征收罪犯勞動補償費並商請有關部門核定撥付使用。
（十）審計處。
負責直屬單位內部財務收支及其有關經濟活動的審計；負責領導幹部離任經濟責任和其他人員經濟責任的審計；負責專項資金、固定資產的審計；指導直屬單位業務建設的審計工作。
（十壹）政策法規處。組織監獄工作政策研究，負責監獄工作簡報、史誌、監獄工作年鑒、黑龍江監獄誌等；指導直屬單位法制建設，承辦有關行政復議和法律申訴等事項；負責規範性文件、規章制度的審批；組織目標管理考核。
（十二）采購管理辦公室。
擬訂直屬單位集中采購具體管理辦法；監督指導直屬單位集中采購活動；受理直屬單位集中采購投訴；承辦與上級采購部門溝通協調等事項。
政治部。
按照幹部管理權限，負責領導班子建設；負責直屬單位黨的建設、幹警隊伍建設、黨員隊伍建設、人才隊伍建設、精神文明建設和思想政治工作、宣傳工作、統戰工作。政治部內設幹部警務處、組織宣傳處、離退休幹部工作處
幹部警務處。按照幹部管理權限，負責直屬單位領導班子建設；負責幹部隊伍建設和人才隊伍建設；負責機關、直屬單位幹部考核、任免、獎懲和日常管理工作；協調管理機關、直屬單位編制工作；負責機關、直屬單位警務督察工作。
組織宣傳科。負責直屬單位黨建工作；負責直屬單位黨員發展和黨員管理教育工作；負責直屬單位精神文明建設、思想政治工作和創模工作；擬訂直屬單位幹部職工政治學習和教育培訓規劃並組織實施；負責法制宣傳、新聞發布、統戰、僑務工作。
離退休幹部工作。負責局機關離退休幹部管理、服務工作；指導直屬單位離退休幹部工作。
機關黨委。按照黨章規定設置；負責機關黨務工作。
紀律檢查委員會（監察室及其合署辦公）。指導直屬單位紀檢監察工作；受理和查處直屬單位副處級以上公務員的違紀問題和申訴復查案件；查處直屬單位發生的重大違紀問題和申訴復查案件；協助分管地區紀檢監察部門查處市屬監獄的重大違法違紀問題。