高精度磁測資料，通常用計算機程序自動進行數據處理。數據處理包括對觀測值進行各種改正（偏向、日變、正常梯度），繪制已改正的磁場值圖，繪制ΔT等值線及ΔTa曲線圖。
數據處理中用計算機處理解釋主要完成以下處理：
4.5.2.1 基點網觀測數據處理
對Ⅰ級基點網作地磁變化改正和質量評價，計算Ⅰ級基點網各基點的磁場平均值；Ⅰ級基點網的平差；對Ⅰ級基點網基點進行正常梯度改正；對Ⅰ級基點網基點進行絕對偏向改正，Ⅱ級基點網的地磁變化改正和質量評價；將Ⅱ級基點網改正到Ⅰ級基點值；在短周期地磁變化強烈的情況下，對測網作地磁變化改正；對測點作基點改正；對測點質量進行評價；相對所取的正常場計算ΔTa異常值；繪制ΔTa平面剖面曲線圖。
4.5.2.2 基點網觀測值的處理
對自動磁力儀進行偏向改正或對磁力儀（如M-33等）作方位誤差改正；進行地磁變化改正；評價觀測質量；作正常梯度改正；相對正常場計算磁異常；繪制ΔTa平面剖面曲線圖；繪制ΔTa平面等值線圖；編制磁異常場的數字模型。
用計算子系統（ACOMM）對場ΔTa進行推斷解釋時，需要進而估計場的分量。壹般通過譜變換法、自動相關函數法、向上、下空間延拓，以及信息綜合，構制二維和三維模型，研究磁場的立體結構。用統計方法對異常進行分區、解釋，最後建立所研究剖面或區域性的物理-地質模型。
模擬方法主要過程是建立所研究地質介質的簡化二維、或三維磁性幾何模型；給單元和圍巖介質以離散、或已知規律形式變化的磁性參數賦值；計算理論場фz，並以限定誤差向試驗場ΔTa進行叠代逼近；滿足叠代精度要求時的地質-地球物理模型初步認為是解釋模型。
在環境勘察中磁測數據的處理與解釋方法同礦產勘查中數據處理與解釋方法基本相同。數據處理大體上可分為濾除幹擾的壹般處理和提取信息的專項處理兩類。壹般處理的目的在於濾除幹擾，得到能客觀反映磁場面貌特征的基礎圖件。專項處理目的在於盡可能多地提取有效信息，或改變異常形式，使其更便於解釋以及與地質等綜合信息的對比分析。專項處理方法大致分成三類：位場轉換處理方法，如化極處理、磁重轉換等；突出“平緩場”弱變化的處理方法，如自適應濾波、互相關濾波等；劃分區域場與突出局部異常的方法，如上、下延拓、求導與積分、匹配濾波等。當然上述處理方法不是壹成不變的，應根據實際情況進行取舍。
磁異常的解釋中要考慮磁異常形態，而它取決於諸多因素，如物體的幾何形態、物體所處位置上的地磁場方向、組成物體巖土的磁化方向、相對於物體軸向的測線方位等等。因此，在解釋磁異常時，要特別註意分析磁異常的平面特征和剖面特征。磁異常反演可以采用比較成熟的壹些反演方法，如特征點法、切線法、梯度積分法、矢量解釋法、線性反演法等等。