1.實現思想認識上的三個轉變。壹是從計劃經濟的思維模式向市場經濟的模式轉變，專業招生規模和人才培養模式必須樹立市場觀念；二是從註重規模和數量到註重質量和建設，重點抓好四個方面:教學基礎條件的建設、素質和創新精神的培養、上下遊緊密結合的薄弱環節、師資隊伍的充實、提高和建設；第三，註重從大起大落的循環向積極穩健的內涵式發展轉變，不求規模，註重質量，因地制宜，辦出特色。
2.在建設實踐中，要做到三個結合、三個突出、壹個重視，做到三個結合:壹是專業設置的現實性和先進性相結合；二是人才培養規格的專業性和復雜性相結合；第三，基礎和前沿教學內容的結合。三講:壹是在教學過程中強調應用和實踐，加強實踐教學環節；二是強調學生綜合素質的培養；三是強調學生的創新和創業精神。壹個重點是重視教學與科研的緊密結合，夯實基礎，不斷提高生物科學與工程學院的辦學水平。在教學實訓基地，科研產品的研發將采取學生畢業實習和畢業論文實驗，形成產學研緊密結合。
二、生物科學與工程學院的定位:壹個教研室。
我們認為主要基於三個原因。第壹，生物科學本身是壹門實驗科學；二是基本具備了教學科研的辦學條件。學校黨政確立了以生物技術為特色的農業大學辦學指導思想，高度重視生物科學與工程學院的建設。建成了比較完善的實驗室和實訓基地，起點高，投入大。第三，生物科學與工程學院科研方向穩定，科研成果顯著，頗具特色。“十五”期間，生物科學與工程學院科技人員主持項目26項，其中國家級項目3項、省部級項目8項、橫向項目5項、校資助項目10(含CAI課件)，獲得科研經費209.75萬元。三。生物科學與工程學院專業教學的辦學特色。
在建設和辦學實踐中，生物科學與工程學院初步形成了“重視生物科學基礎教育，以下遊技術加強工程專業建設，註重現代生物技術的融合滲透，實現傳統發酵工程的轉型升級”的優勢和特色。
1.以深化改革為動力，優化人才培養方案。
在教育部關於不同專業培養目標和業務要求的總原則下，根據我系生物工程與生物技術專業的特點，以及相關學科的優勢，並借鑒姐妹院校的經驗，對生物工程與生物技術專業的培養計劃和教學計劃進行了四次修訂，以更好地適應教育部對高等教育現代化、多樣化、個性化和大眾化的要求。也能充分發揮我校生物學的優勢，體現我校生物科學與工程學院本著“強化基礎、拓寬專業、優化結構、精簡內容、拓展選修課、突出個性、註重實踐、形成特色”的原則設置課程體系。以“平臺+模塊+選修課”的形式構建課程體系。第壹個平臺:通識教育平臺。開設此類課程是對學生進行通識教育和素質教育的基本途徑，主要包括“兩課”、外語、體育、大學信息技術基礎、管理學、大學語文基礎、形勢與政策。第二個平臺:基礎課和專業基礎課的平臺。第三平臺:專業課平臺+模塊。“選修課”是與生物工程和生物技術專業密切相關的、教授新興學科和邊緣學科知識的跨學科、跨專業的課程和選修課。選修課包括限定選修課(又稱專業方向選修課)和選修課(又稱公共選修課)。
生物工程與生物技術專業在第二平臺基礎課和專業基礎課的課程設置上，壹是突出工科基礎，註意加強工科專業必修的數學、物理、化學等課程的教學時數；二是增加理科內容，增加普通生物學、細胞生物學、基礎生物化學、遺傳學、微生物學、分子生物學、儀器分析、化工原理、機械制圖等生命科學的重要基礎理論。
第三平臺專業課+模塊，生物工程專業課包括發酵工程、生物工程設備、生物質分離工程、生化檢測與控制、現代生物技術概論等五門主幹課程。同時增加兩個模塊化課程，即模塊1:工業發酵方向和模塊2:生物制藥方向，每個模塊分別有9-10個模塊化課程。生物技術專業主要課程包括工業微生物學、發酵工程與設備、生物物質分離工程、基因工程、酶工程、細胞工程等6門主幹課程。同時增加兩門模塊化課程，即模塊1:分子生物學方向和模塊2:蛋白質工程方向。每個模塊有8-9門專業模塊課程。尊重學生選擇專業興趣的自主權，調動學生在理工科專業發展中的主動性，將學科發展方向與學校專業特色相結合，充分利用學校在生命科學領域的教學和科研優勢，充分體現以發酵工程為基礎的生物工程工程專業和以細胞工程為基礎的生物技術科學專業各自的特色和人才培養的專業特色。
2.以課程建設為紐帶推進師資隊伍建設。
生物科學與工程學院成立的時候，教職員工的地位。199生物科學與工程學院成立時，專業教師10人，助教3人，平均年齡35歲。50歲以上1人，40-46歲以上4人，40歲以下8人。碩士學歷3人，本科學歷7人，專科學歷3人。正教授1人，副高級職稱2人，中級職稱5人，初級職稱5人。這樣的師資隊伍，從數量、學歷、職稱來說都是不合理的。因此，充實和加強師資隊伍建設是生物科學與工程學院學科建設的主要任務。學校壹直堅持把師資隊伍建設放在重要位置。生物科學與工程學院正在積極引進高素質人才，主要根據生物工程與生物技術基礎課和專業課所需師資，同時註重現有師資的培養和提高，主要采取以下方法:
生物科學與工程學院師資隊伍建設的幾點措施？
學科建設的核心是師資隊伍建設。沒有壹支高素質的專業教師隊伍，就無法培養出高素質的專業技術人才。要給學生“半桶水”，教師必須有“壹桶水”。生物科學與工程學院的師資隊伍建設得到了黨政、教務處、人事處及相關職能部門的大力支持。在實施“以課程建設為紐帶推進師資隊伍建設”計劃中，我部黨政在推薦、組織、協調等方面做了以下工作:
(1)加快培養和引進高學歷人才，提高教師整體素質。
A.選拔優秀青年教師申請定向培養博士、碩士研究生。
1998-2002年四年間，生物科學與工程學院根據課程建設的需要，推薦了4名具有碩士學位的青年教師申請全國著名高校生物工程核心課程在職定向培養博士生。1998郭美金同誌被上海華東理工大學生命工程學院生物化學專業錄取為博士研究生；2000年，霍光華同誌考入南昌大學食品科學與食品資源開發專業博士生。2001，孫同誌被上海交通大學分子生物學專業錄取為博士生。2002年，武笑羽同誌被華東理工大學生物化學專業錄取為博士生。2003年，陳明輝同誌被錄取為生物材料分離工程專業定向在職培養碩士。
B.新老師。選拔高學歷的優秀畢業生充實師資隊伍。生物科學與工程學院成立四年來，先後從不同高校、不同專業引進了八名青年教師，其中碩士四名，本科生四名。
(2)送青年教師去名牌大學深造。
我系於2000年和2001年分別派博古教授和陳明輝助教到華中農業大學生命科學學院和華東理工大學生物化學與化工學院進修生物技術和分子生物學，並返校承擔相應進修課程的教學任務。
(3)對青年教師實行導師制，進行在職培訓。
在生物工程專業，我系高級職稱教師承擔的所有課程都安排青年教師全程聽課，對青年教師實行導師制進行課程化培訓，當好講師的助教，講師和助教壹起備課。如塗教授講授微生物學，根據教學大綱編寫教案、講義、CAI課件腳本、微生物學題庫等。助理教授協助塗教授開發CAI課件、打印題庫、全程聽課、批改題庫中的作業以及課後和網上答疑。武笑羽教授主講《工業微生物生理學與遺傳育種》，李訓航同誌任助教，他也是。通過青年教師導師制，對提高青年教師的教學水平大有裨益。
(4)從校辦企業中選拔具有實踐經驗的專業科技人才，充實師資隊伍。
2001至2002年，在人事處的大力支持下，我科先後從江南制藥廠抽調了副研究員、曾健副主任、魏工程師三名本科以上專業技術人才到我科擔任教師。經過教師資格培訓，和魏兩位同誌分別獲得了中國人民大學和中國普通高等學校教師資格。同誌承擔了研究生現代儀器分析和本科生發酵分析的教學任務，魏同誌承擔了微生物學和農用抗生素、殺蟲微生物學的教學任務，曾健高級工程師擔任生物科學與工程學院教學實訓基地副主任，負責安排生物科學與工程學院學生的教學和畢業實習。
(5)聘請校外知名專家、教授擔任我系兼職教授。
從1999年至今，生物科學與工程學院先後推薦並獲得學校批準，聘請了8名校內外知名教授、專家、企業家擔任我系兼職教授。他們分別是華東理工大學生物化學與化工學院博士生導師張思良教授和褚矩教授。上海交通大學生命科學與技術學院博士生導師鄧、周秀芬教授；華東農業大學生命科學與技術學院博士生導師余教授；山東勝利股份有限公司董事長孫建國、總經理孫；景德鎮市副市長、農業大學校友周華寶，高級工程師。這些兼職教授不定期來校進行學術訪問和作學術報告，對加強校企之間的密切聯系，安排畢業實習，擴大生物科學與工程學院的對外影響起到了積極的作用。生物科學與工程學院經過四年實施“以課程建設為紐帶，促進師資隊伍建設”，取得了顯著成效。專業教師和教學輔助人員數量成倍增長，專業教師的學術水平和職稱顯著提高。生物科學與工程學院現有教職工36人，其中專任教師21人，助教8人，平均年齡32歲。專任教師和教學輔助人員分別占教職工的58.33%和22.22%，全系學生與教師的比例為21:6，81 = 1:32.43。不同學歷層次教師人數和比例:1名博士(3名學生在讀)，占4.76%；碩士學歷9人，占42.86%；本科生11人，占52.38%。不同職稱教師人數和比例:1正教授，占4.76%；副高級職稱7人，占33.33%；中級職稱5人，占23.81%；初級職稱8人，占比38.10%。
3.以培養創新人才為目標改革實驗教學體系。
鑒於生物工程和生物技術應用性強的特點，我們註重實驗教學體系的改革和完善。壹是在生物科學與工程學院的整體規劃下，改革了我系專業基礎課實驗課從屬於理論課，實驗室附屬於教研室的傳統格局。按照“統壹管理、優化配置、資源共享”的原則，成立生物科學與工程學院教學實驗中心，由系副主任張洪宇擔任中心主任，規範實驗室管理，提高實驗室、儀器設備的利用率；二是開展了“將微生物學系列課程實驗教學內容有機重組為基本操作技能、基礎理論驗證、微生物遺傳改良、微生物技術應用、微生物研究課題等五大模塊”的實驗教學改革，使生物工程專業學生獲得系統規範的微生物菌種、物種保護、遺傳改良的基本實驗操作技能，收到了非常好的教學效果；三、在99級生物工程專業的實踐教學中，發酵工程與設備、生物技術、代謝控制發酵三大課程的教學實踐，充分利用我系教學實訓基地中試車間的八套全自動不銹鋼發酵罐及其配套設備作為實習場所；四、99級生物工程專業第七期畢業實習為期15周，安排60-70名學生在校外10多個實習基地實習。壹半左右的學生留在系裏的實習基地進行畢業實習，科研產品開發(復合微生物肥料)。實習內容以三項技術為基礎:無菌操作技術、純培養技術和顯微操作技術。貫穿發酵技術、檢測技術和產品制備技術三大技術，讓學生充分利用實訓基地先進的發酵設備、檢測設備和後處理設備，用不同的微生物菌種發酵制成壹種或多種產品，讓每個學生在實習期間得到全面的實踐訓練。在學校教務處和團委舉辦的第四屆“興贛杯”科技論文大賽中，生物工程99級學生提交了7篇科技論文，其中4篇論文獲獎:壹、二等獎1，三等獎2篇。並有兩篇優秀論文被學校推薦參加第八屆“挑戰杯”大學生課外學術作品大賽決賽，分別獲得江西賽區優秀作品二等獎。
4.加強實驗室和教學實訓基地建設。
生物科學與工程學院的實驗室建設和實訓基地建設得到了學校黨政的高度重視和資金的大力支持。四年來，學校投入近400萬元用於我系實驗室建設和實訓基地建設，以及教學儀器設備的購置。實驗室建設。2000年至2003年，學校投資80多萬元，改建了10個高標準專業實驗室。2000年投資近65438+萬元，將生物工程樓二樓東側200 m2改造為發酵分析實驗室，主要承擔生物技術、代謝發酵分析、儀器分析三門課程的實驗教學任務，可容納100多名學生同時進行實驗。2001年，投資40多萬元，按照國家重點實驗室標準，將生物工程樓五樓800 m2改造為微生物實驗室和工業微生物生理與遺傳育種實驗室。每個實驗配有三個近70平米的實驗。實驗室的實驗桌全部采用進口耐腐蝕、防火的理化材料，6個實驗室可容納200多名學生同時進行實驗。微生物實驗室主要承擔微生物學、土壤微生物學、環境微生物學、能源微生物學、食品微生物學、食用菌、病毒學、微生物肥料等8門課程的實驗教學任務。工業微生物與遺傳育種實驗室主要承擔微生物生理學、微生物遺傳育種、農用抗生素與殺蟲微生物學、酶工程、生物制藥等5門課程的實驗教學任務。2003年，投資近30萬元將生物工程樓壹層800平方米改造成分子生物學實驗室，預計今年8月竣工。分子生物學實驗室建成後，將承擔分子生物學、細胞生物學、普通生物學、基因工程、細胞工程等5門課程的實驗教學任務。
2)教學實訓基地建設。
2001-2003年期間，學校投資220多萬元為我系新建教學實訓基地，其中40萬元用於700平方米的土建工程建設。基地土建工程包括120m2中試發酵車間、菌種制備室、搖瓶培養室、中間檢測室、儀器室、發酵產物後處理制備室、藥材倉庫、學生實習教室等。基地占地面積約10000m2。發酵中試裝置配有兩套全自動不銹鋼發酵罐，價值1.4萬元，包括15升、50升、500升、1.000升，及其配套的自動空氣、蒸汽、動力系統。基地內每個實驗平臺配有價值近40萬元的儀器設備，每年為生物工程與生物技術專業的本科專業如發酵工程與設備、生物技術、代謝控制發酵、酶工程、蛋白質工程、生物制藥、微生物肥料和農用抗生素與殺蟲微生物學以及生物工程與生物技術專業的畢業生建設實訓基地。生物科學與工程學院實驗實訓基地占地5,000m2，學生壹般。
3)儀器設備的采購。
2000-2003年，學校先後投資近1萬元，為生物工程與生物技術專業的四個實驗室購置了100臺雙筒高倍生物顯微鏡、各種型號和規格的離心機、光譜儀、凈化臺、搖瓶機、恒溫箱、冰箱、高壓滅菌器等高檔儀器設備。生物科學與工程學院儀器設備總量達829萬元，生均儀器設備量達12，173元。生物科學與工程學院的教學條件建設，從學校的角度來看，實驗室和實訓基地的建設投入大，起點高，為生物工程與生物技術專業本科生提高實驗和實際操作技術提供了良好的硬件環境，為提高本科教育質量奠定了良好的基礎。