交通事故醫療費用責任由責任強制保險公司承擔1，000元，不足部分由商業第三者責任保險公司承擔。
第三方保險壹般不承保非醫保藥品，這要看其在簽訂保險合同時是否進行了明確提示。
1.已明確表示非醫保藥品(自費藥品)超出強制保險限額的部分，由原、被告雙方按責任分工承擔。妳應對這起交通事故負全責，所有費用由妳承擔。但是，自費藥可能存在合理性問題。如果認為不合理，可以申請鑒定，去掉不合理的費用。
2.如果沒有明確提示，車主可以直接要求商業險的第三者責任險公司承擔。
自費藥品”是指使用國家基本醫療保險範圍以外的藥品發生的醫療費用。對於這部分費用，保險公司通常會拒賠。理由是保險條款中約定的“保險責任按照國家基本醫療保險的範圍和標準計算”，免除了第三者“自費藥”的責任。保險公司拒賠“自費藥”是否合理合法？
律師認為，根據《保險法》相關規定，保險公司免除保險責任必須有明確約定和明確告知。實際上，保險條款中規定“保險賠償責任按照國家基本醫療保險的範圍和標準計算”，從字面上不能直接理解為“自費藥”不賠的意思，也沒有保險公司在投保時明確告知“自費藥”不賠。因此，保險公司拒賠“自費藥”是違法的，違背了被保險人參保的初衷。
交強險在確定保險公司責任時不能扣除“自費藥”。
在保險條款中，保險公司同意按照國家基本醫療保險的範圍和標準計算保險賠償責任。但考慮到強制保險具有法律強制性，具有較強的公益性特征，在確定強制保險的賠償金額時，不宜扣除“自費藥品”。
商業第三者責任險根據保險條款對“自費藥”進行處理。
商業第三者責任險明確約定按照國家基本醫療保險的範圍和標準計算保險責任的，保險公司依據該約定扣除“自費藥品”進行理賠，法院應予支持。
需要註意的是，如果同時有強制保險和第三者責任險，應優先賠付強制保險限額內的自費藥，其余醫療費用在第三者責任險中賠償。