藥品GMP認證申請流程如下：
1、申報企業到省局受理大廳提交認證申請和申報材料；
2、省局藥品安全監管處對申報材料形式審查 （5個工作日）；
3、認證中心對申報材料進行技術審查 （10個工作日）；
4、認證中心制定現場檢查方案（10個工作日）；
5、省局審批方案 （10個工作日）；
6、認證中心組織實施認證現場檢查 （10個工作日）；
7、認證中心對現場檢查報告進行初審 （10個工作日）；
8、省局對認證初審意見進行審批（10個工作日）；
9、報國家局發布審查公告（10個工作日）。
藥品GMP 認證所需資料如下：
1 、 藥品 GMP 認證申請書（壹式四份）；
2 、《藥品生產企業許可證》和《營業執照》復印件；
3 、藥品生產管理和質量管理自查情況（包括企業概況及歷史沿革情況、生產和質量管理情況、前次認證缺陷項目的改正情況）；
4 、 藥品生產企業組織機構圖（註明各部門名稱、相互關系、部門負責人） ；
5 、 藥品生產企業負責人、部門負責人簡歷；依法經過資格認定的藥學及相關專業技術人員、工程技術人員、技術工人登記表，並標明所在部門及崗位；高、中、初級技術人員占全體員工的比例情況表；
6、 藥品生產企業生產範圍全部劑型和品種表；申請認證範圍劑和品種表（註明常年生產品種），包括依據標準、藥品批準文號；新藥證書及生產批件等有關文件資料的復印件；
7、 藥品生產企業周圍環境圖、總平面布置圖、倉儲平面布置圖、質量檢驗場所平面布置圖；
8 、 藥品生產車間概況及工藝布局平面圖（包括更衣室、盥洗間、人流和物流通道、氣閘等，並標明人、物流向和空氣潔凈度等級）；空氣凈化系統的送風、回風、排風平面布置圖；工藝設備平面布置圖；
9 、 申請認證型或品種的工藝流程圖，並註明主要過程控制點及控制項目；
10 、藥品生產企業（車間的關鍵工序、主要設備、制水系統及空氣凈化系統的驗證情況；檢驗儀器、儀表、衡器校驗情況；
11 、 藥品生產企業（車間）生產管理、質量管理文件目錄。
藥品 GMP 認證的證書有效時間如下：
1、《藥品 GMP 證書》有效期壹般為 5 年；
2、新開辦藥品生產企業的《藥品 GMP 證書》有效期為 1 年。藥品生產企業應在有效期屆滿前 6 個月，重新申請藥品 GMP 認證。新開辦藥品生產企業《藥品 GMP 證書》有效期屆滿前 3 個月申請復查，復查合格後，頒發有效期為 5 年的《藥品 GMP 證書》。
綜合所述：制訂和實施GMP的主要目的是為了保護消費者的利益，保證人們用藥安全有效；同時也是為了保護藥品生產企業，使企業有法可依、有章可循；另外，實施GMP是政府和法律賦予制藥行業的責任，並且也是中國加入WTO之後，實行藥品質量保證制度的需要--因為藥品生產企業若未通過GMP認證，就可能被拒之於國際貿易的技術壁壘之外。
法律依據：
《中華人民***和國藥品管理法實施條例》第五條
省級以上人民政府藥品監督管理部門應當按照《藥品生產質量管理規範》和國務院藥品監督管理部門規定的實施辦法和實施步驟，組織對藥品生產企業的認證工作；符合《藥品生產質量管理規範》的，發給認證證書。其中，生產註射劑、放射性藥品和國務院藥品監督管理部門規定的生物制品的藥品生產企業的認證工作，由國務院藥品監督管理部門負責。
《中華人民***和國藥品管理法實施條例》第六條
新開辦藥品生產企業、藥品生產企業新建藥品生產車間或者新增生產劑型的，應當自取得藥品生產證明文件或者經批準正式生產之日起30日內，按照規定向藥品監督管理部門申請《藥品生產質量管理規範》認證。受理申請的藥品監督管理部門應當自收到企業申請之日起6個月內，組織對申請企業是否符合《藥品生產質量管理規範》進行認證；認證合格的，發給認證證書。