1964年10月，醫院正式開診，名稱為“天津中醫學院附屬王串場醫院”。
1970年，天津中醫學院遷往石家莊，本院更名為“天津市河北區王串場中醫醫院”。
1981年2月，天津市河北區王串場中醫院重新歸屬中醫學院，定名為天津中醫學院第二附屬醫院。1983年，申報市級課題《中醫藥治療急性心肌梗死臨床研究》，是天津市中醫界第壹個立項的市級重點課題。
1989年9月，新門診樓啟用。
1992年，天津中醫藥大學第二附屬醫院確定為衛生部臨床藥品研究基地。
1994年12月，被評選批準為三級甲等中醫院。
2001年，婦科被批準為國家中醫藥管理局重點學科。
2003年5月， 在海河醫院籌建SARS第五病區，為首個中醫病區，並接受了世界衛生組織（WHO）的檢查。榮獲國家人事部、衛生部、中醫藥管理局授予的“全國衛生系統抗擊非典先進集體”榮譽稱號。
2003年，863項目“中藥關鍵技術及GCP平臺建設研究”通過國家科技部課題立項。
2004年底，成為天津醫學高等專科學院臨床教學基地。
2005年6月，世界中醫藥學會聯合會婦科專業委員會首屆學術研討會暨成立大會在中醫二附院隆重召開，學會掛靠本院。
2005年10月31日，天津市呼吸病研究所第三研究部掛牌運行，婦科、心血管、腦病、呼吸、糖尿病足被評為天津市重點專科（專病）。
2006年4月，醫院更名為“天津中醫藥大學第二附屬醫院” “天津中醫藥大學第二臨床醫學院”，並通過三甲復評審。
2006年10月，“冬病夏治理論在COPD防治中的作用及機理研究”獲國家自然科學基金立項。
2007年，“中醫內科”被評為教育部國家重點學科；呼吸科、婦科、腦病科被評為國家中醫藥管理局重點專科。呼吸科治未病研究室、婦科生殖健康研究室被評為天津市重點研究室。
2007年，“呼吸常見病研究”獲國家科技部十壹五支撐計劃，“建立評價妊娠期應用中藥有效性、安全性的研究技術平臺”獲科技部中醫藥行業科研專項。
2008年7月，天津中醫藥大學131人才公布：濱海學者1名 ，中青年名醫5名，中青年學術帶頭人12名。
2008年9月，獲國家重點基礎研究計劃（973計劃）支持，至此承擔各級科研課題50余項，科研經費1500萬元。