1)更新觀念，加強保護中藥資源的宣傳。
目前，“取之不盡，用之不竭”的錯誤觀念仍困擾著許多人，極大地影響著藥材生產和中藥資源的保護與管理。因此，應通過多種形式廣泛開展宣傳教育，宣傳保護中藥資源、維護生態平衡的積極作用，以及破壞資源的嚴重後果，強調保護野生藥用動植物資源的重要性和必要性。
2)加強中藥資源保護和管理的法制建設。
建立壹套切實可行的中藥資源保護和管理法規，健全中藥資源保護組織，培養高水平的中藥資源保護和研究科技隊伍，是中藥資源保護和管理的可靠保證。目前，我國第壹部關於中藥資源的法律法規已經頒布，中藥資源的保護和管理有了法律依據。各地要積極爭取地方政府的支持和領導，逐步完善野生藥材資源保護的地方性法規和實施細則，並付諸實施，做到有法必依、執法必嚴、違法必究，切實保障中醫藥資源保護工作的正常開展。
建立健全實施中醫藥資源保護法律法規的組織機構，承擔協調、監督和管理職責，並在中醫藥管理體制中設立相應的實施監督機構，配合其他部門的資源保護機構做好資源保護工作。
充實中藥資源保護機構的工作人員和研究人員，加強技術培訓，不斷提高其專業技術水平，在保護、管理和科學研究中發揮更大作用。國家應有專項資金保證中藥資源的正常保護和管理。
3)建立中藥資源保護和實驗研究基地。
要建立國家大型藥用植物(動物)種質基因庫，野生物種、引種栽培研究實驗基地，以及相應的中國代表性地區中藥資源綜合保護區。收集、保存和利用現代技術研究藥用種質基因，與國內外開展多種形式的合作和多學科交流，促進中藥資源保護事業的發展。比如雲貴高原、青藏高原資源豐富，高原特有物種、民族藥多，要進行物種收集和研究；新疆等沙漠地區主要收集和保存沙生藥用動植物物種，開展生動的沙生植物藥用研究，普及沙生藥用植物栽培技術，逐步綠化沙漠，擴大藥源；東北地區主要從中國收集寒地動植物種質，並進行引種馴化。低山、丘陵、盆地、平原是我國藥材集中、適宜人工栽培的地區。同時，要特別註意人工培育品種和品系的種質基因的收集。在野生轉家種的國內試驗中，要註意研究合理的狩獵方法和優質高產技術，並及時推廣。
4)中藥資源保護、開發和利用協調發展。
中藥資源保護的目的在於合理開發利用。只有在實際工作中將中藥資源的保護與中藥的生產和發展有機地結合起來，才能真正達到目的。目前，自然保護區、動植物園、樹木園和資源利用部門之間的合作關系尚未完全建立。雖然國家壹再強調資源的合理利用，但長期以來資源開發與資源保護仍然脫節，加劇了保護與利用的矛盾，影響了資源的合理利用。因此，各類保護區、種質基因庫、引種馴化基地和中藥材生產收購部門應進壹步合作。要研究野生物種轉化為家養物種的技術和恢復資源的方法；收集野生種質和人工培育的優質品種並妥善保存，為科學研究提供材料，為生產提供優質種源。
5)確定中藥資源瀕危物種的標準。
目前，藥用植物(動物)瀕危程度的標準仍處於定性評價階段。1992第17卷第2期。(中國中醫藥雜誌)發表了《藥用植物珍稀瀕危程度評價標準的探討》壹文，從藥用價值、分類學意義、分布與生態環境要求、野生資源、野生資源減少率、栽培狀況、保護狀況、綜合開發狀況等八個方面對藥用植物進行了綜合評價，確定了瀕危物種、瀕危物種和受威脅物種。在此基礎上，根據中藥資源狀況和人類影響，對我國珍稀瀕危藥用植物(動物)進行了調查和評價，編制了《中國珍稀瀕危藥用植物(動物)名錄》，作為保護藥用物種的依據。
6)監測中藥資源的動態變化
中藥資源動態變化監測是對中藥資源的種類、數量(產量和儲量)、生態環境的變化和群落的演替規律，以及影響中藥資源變化的諸多因素(如市場需求、價格因素等)進行定期或長期的觀察和切合實際的綜合統計分析。及時預測中藥資源的消長與市場、價格等因素的關系，為決策部門提供參考。中藥資源的動態變化監測是中藥資源保護和管理長期正常維護和正確發揮作用的重要環節。監測的主要任務包括:監測物種和區域情況報告。監測的品種主要是市場需求量大、資源相對不足的藥用品種；資源稀缺、易受威脅的藥用物種和國家保護的野生藥用物種；監測的重點區域為中藥資源開發破壞區和保護區，其他區域為壹般觀察區；監測報告主要包括藥用動植物、分布範圍、生境、繁殖方式、種群結構、資源消長、市場需求、價格變化和保護現狀等。主要監測方式可根據監測品種的不同情況確定，定點監測和綜合了解相結合。對於重點品種，每年至少有1-2次1實地考察，並做好詳細記錄，逐級整理報告。
中藥資源監測可以由中藥資源保護管理機構承擔。遍布全國的中藥資源保護(監測)分支機構和監測網點，除完成年度監測任務外，還承擔國家組織的保護物種定期調查，組織專項調查隊伍，對瀕危保護物種資源進行詳細摸底，為調整編制中藥資源保護名錄提供依據。