而且還會繁殖，出現孢子等粒徑較小的微生物，這就需要對潔凈室進行高水平的消毒處理。
壹般情況下，制藥廠會在潔凈區的新風系統中配備臭氧消毒設備，進行日常的空間消毒，但事實驗證，臭氧很難達到全部的消毒要求，也就是說消毒效果並不理想。
壹般制藥企業根據潔凈級別，表面消毒和空間消毒的滅菌方案建議如下：A級區域：是直接或間接接觸無菌產品的重點區域，A級區域微生物檢查結果為<1cfu/m3。因此，在A類區域使用的消毒劑應具有很好的保護消毒劑本身的無菌性，且無殘留，以消除產品被消毒劑汙染的風險。
根據美國食品及藥物管理局《按現行藥品生產質量管理規範（cGMP）生產的無菌藥品的無菌加工行業指南》，日常使用的消毒劑應能有效針對從工廠設施的存活率中回收的常見微生物群落。許多常用消毒劑對孢子無效。例如，70% 的異丙醇對芽孢桿菌孢子無效。因此，如果按照書面計劃使用，並且環境數據表明存在孢子形成微生物，合理的消毒計劃還包括殺孢子劑。
當 A 級區域存在細菌孢子時，普通的表面殺孢子劑只能用於表面擦拭，但不能解決空間孢子的問題，因此需要使用 VHP 進行熏蒸。但高濃度雙氧水 VHP 容易腐蝕設備，不便頻繁使用，解決辦法是在日常消毒時用無殘留表面殺孢子劑和消毒劑輪換使用，做到提前防控，減少熏蒸頻率。USP<1072> 還指出：建議殺孢子劑和消毒劑輪換使用。
因此，根據A類區域的特點，我們提出的方案是：
使用無菌包裝的酒精消毒劑進行日常清潔消毒；
使用雙氧水殺菌劑，避免細菌孢子和黴菌出現。
發現汙染程度較高的情況，需要進行空間熏蒸消毒。