藥品的三個性質為安全、有效和質量可控。雜質的研究應從對藥品安全性和質量可控性兩個方面的影響來考慮。化學試劑作為廣義概念上的雜質的壹部分，也需要評估其殘留對藥品安全性和質量可控性的影響，其殘留限度的制定也是如此。如某化學試劑有基因警示結構，其限度應根據相應指導原則（《ICHM7》）制定。如為無機鹽，應根據無機鹽的控制策略及相應指導原則制定，在API成品檢測熾灼殘渣，研究元素雜質（《ICHQ3D》）等。某些有機試劑如殘留溶劑中的四類溶劑的限度則應該先查找相應的安全性的數據，如動物毒理研究數據、職業環境暴露量研究數據等，然後根據安全性的數據計算相應的殘留限度。
通過PDE計算限度：
ICHQ3C中收載了PDE的計算方法：
PDE = NOEL x Mass Adjustment/[F1 x F2 x F3 x F4 x F5]
其中PDE為允許日暴露量，單位為mg/天；NOEL為該雜質的最大無作用的劑量，單位為mg/kg/天。
Mass Adjustment為體重調整系數，壹般取為50kg。F1…..F5為各種修正因子，其含義與應取的值請查閱ICHQ3C相應內容，不再細述。
通過以上公式得出PDE的值之後，然後除以藥品的最大日劑量，即得出該化學試劑的限度。
從LD50計算NOEL
很多時候我們查找不到NOEL的數據，我們只能查到LD50（半數致死量）。目前最權威的計算方法出自歐盟原料藥委員會在其發布的《原料藥工廠中清潔驗證指南》，其中收載了由LD50計算NOEL的公式：NOEL=LD50×70/2000。但這壹公式卻會誤導PDE的計算，因為很多人會用這壹公式計算出來的NOEL直接代入上文的公式計算PDE，卻沒有註意到《原料藥工廠中清潔驗證指南》壹文中的NOEL 的單位是mg/天，而不是上文公式中的mg/kg/天。原因就是公式中的70是歐洲人的評價體重。所以如果需要用LD50計算NOEL用於計算PDE，則不應該乘以70，公式應該是NOEL=LD50/2000，2000是經驗常數。該公式可參見文獻《Layton D W，Mallon B J，Rosenblatt DH，et ．Deriving allowable daily intakes for systemic toxicants lackingchronic toxicity data[J]．Reg02To'xicol Pharm，1983，3(1)：224．》，