由於圈養條件下的衛生條件、氣候條件、飼養管理等因素，山羊容易發生傳染性結膜炎、傳染性膿腫、疥瘡、羊腸毒血癥等疾病。如果不及時采取有效的防治措施，往往會給農民造成很大的損失。
1.傳染性結膜角膜炎是由嗜血桿菌和立克次氏體引起的反芻家畜急性傳染病，常發生在氣溫高、蚊蠅多的夏秋季。該病易發生在飼養密度高、圈舍衛生差、空氣流通差、氨氣濃度高的環境中。
臨床癥狀:該病主要損害眼部，引起結膜和角膜明顯炎癥改變，怕流淚，結膜潮紅充血，眼角有粘稠或膿性分泌物，少數形成角膜雲、白斑或致盲。
預防和治療
①隔離病羊，及時對圈舍進行清潔消毒。
②用2% ~ 5%硼酸水或淡鹽水或0.01%呋喃西林沖洗眼睛。幹燥後可以選擇紅黴素、氯黴素、四環素、2%氯化汞或2%可的松等眼膏。
③青黴素或氯黴素加地塞米松2ml，0.1%腎上腺素1ml也可混合後滴眼，每日2 ~ 3次。
④角膜混濁或白內障時，可滴加50萬單位雲帆或青黴素，眼瞼下皮下註射病羊全血65，438±00ml；或眶上孔內註射鏈黴素溶液50萬單位(5ml)，每2天1次。
2.羊傳染性膿腫該病又稱“羊口潰瘍”，由病毒引起，表現為在唇部等處的皮膚、粘膜上形成丘疹、膿腫、潰瘍和疣狀厚痂。主要通過筆、用具或皮膚擦傷傳播，呈團塊狀，可對羊危害多年。
有臨床癥狀的羊發病後，食量減少，癥狀嚴重者停止集食，逐漸消瘦死亡。
預防和治療
①常規防疫:每年3月或9月，每只羊口腔黏膜註射口瘡減毒細胞冷凍疫苗0.2 ml。
②少用粗硬飼料，防止外傷感染，及時隔離病羊，用2%燒堿、10%石灰乳或20%熱草木灰消毒圈舍和用具。
③用0.1% ~ 0.2%高錳酸鉀溶液沖洗傷口，然後塗2%龍膽紫、碘甘油、5%土黴素軟膏或青黴素呋喃西林軟膏，每日2次。
3.羊疥癬又稱“疥癬”，表現為脫毛、瘙癢，多發生在冬春季節，尤其是冬季。病羊極其瘙癢，表現為到處抓撓，用嘴咬，引起皮膚發炎、膿腫，皮膚增厚並覆蓋大量痂，羊毛大塊脫落，尤其是頭部。病羊往往死於長期的焦慮、貧血和消瘦。
最簡單的防治方法是藥浴，藥液可以是0.05%辛硫磷乳油或0.1% ~ 0.5%敵鼠溶液。藥浴要在天氣晴朗無風的時候進行，現在用的是藥水，藥水的溫度要保持在20℃ ~ 35℃。20%二甲胺EC 1kg 500 ~ 600倍稀釋液也能有效殺滅疥瘡，控制疥瘡的發生。此外，可用上述藥液剪擦患處，或皮下註射伊維菌素0.2毫克/公斤體重或20%碘硝基酚0.05毫克/公斤體重，治愈率可達90%以上。對未感染的健康羊，每年春秋兩季用2000-5000倍的低濃度敵鼠溶液進行藥浴預防，並對羊舍及用具噴灑0.1%敵鼠溶液。
4.羊腸毒血癥是由D型魏氏梭菌在羊腸內繁殖產生毒素引起的。人死後腎臟易軟化，故又稱“軟腎病”，又因其多次急性發作，故又稱“快疫”。多見於目光接觸良好、2歲以下的羊，偶發性。雨季，氣候突變，暴食幼草和精料，運動不足都是誘因。發病時，躺著或跑著，咬緊牙關，側身倒地，四肢抽搐，左右翻滾，頭頸向後彎曲，呼吸急促，口吐白沫，有時痛苦呻吟，壹兩個小時內死亡。
預防和治療
①每年春秋兩季進行防疫，皮下或肌肉註射羊三防疫苗(快速流行、突然發作、腸毒血癥、羔羊痢疾)5 ml。
(2)防止過食嫩多汁的飼料和精飼料，適當運動。
③如果病程較長(2小時以上)，每只動物可口服磺胺10g ~ 20g或註射免疫血清。
④每塊肌肉註射氯黴素0.5g ~ 0.7g，每日3次。
⑤僅肌肉註射青黴素654.38+0.6萬單位，鏈黴素500 mg，每日4次。
⑥對於壹些因過量飼餵精料或嫩多汁飼料而引起的瘤胃臌脹的急性病例，可用套管針穿刺放氣緩解呼吸困難。3毫升~ 5毫升發酵用甲醛和300毫升~ 500毫升水，或3毫升魚脂，10毫升松節油和20毫升酒精，混合200毫升水。