1，藥物療法
包括免疫制劑、抗病毒制劑、中藥制劑等藥物。
2.冷凍療法
用液氮或二氧化碳幹冰冷凍，疣組織(即皮膚受損部分)就會壞死。冷凍療法最大的優點是可以快速局部去除疣，治愈率在70%左右，但復發率高。治療過程中會出現局部紅腫、疼痛、水皰潰瘍反應。目前很少使用。
3.激光療法
適用於淺表尖銳濕疣；它的特點是見效快，治療的時候就可以把疣去掉。常用的是二氧化碳激光，燒灼疣，壹般1次可使疣脫落。但由於激光束過於集中，激光治療只適用於疣體較小的尖銳濕疣，如果疣體較大則不適合。激光治療見效快，但復發率也高。
4、電灼療法
電灼術是壹種更古老的治療方法。以前醫生常用高頻電刀燒灼尖銳濕疣等皮膚贅生物。其特點是操作簡單，見效快，但損傷大，燒傷創面恢復慢，會留下疤痕，復發率高。
5、手術治療
對於大而孤立的有蒂疣，可以考慮手術切除。尖銳濕疣壹般不提倡手術切除，因為手術治療後尖銳濕疣容易復發，使治療失敗。但對於有蒂、大疣或疑似惡變者，可考慮手術切除。部分尖銳濕疣患者生長過快或大如菜花，其他治療難度很大，可以考慮手術治療。為防止復發，術後治療應結合其他治療。
6.光動力治療
療效確切，清除率高，復發率低，安全無創，無麻醉、無痛苦、無疤痕。最大的優點是可以明確人乳頭瘤病毒的亞臨床感染和潛伏感染病竈，顯著降低復發率。特別適用於尿道、宮頸、肛門等特殊解剖部位的治療，尤其適用於復發性尖銳濕疣及其他治療無效的患者的治療。或結合其他治療方法進行綜合治療。是目前治療尖銳濕疣的理想方案。