慢性肝炎的炎癥反應機制與急性肝炎基本相似。但由於肝細胞炎癥性壞死、再生和纖維組織增生的反復發生，很可能改變原有的肝小葉結構，進展為肝硬化的病理改變。如果膽管細胞被排斥，就會發生膽汁性肝硬化。因此，慢性肝炎的治療，除了治療肝臟炎癥外，還要進行抗肝纖維化治療，以防止肝小葉結構的破壞和肝硬化病變的形成。另外，要進行長期有效的治療，阻斷病因。
用免疫調節劑治療自身免疫性肝炎。主要包括適當休息、合理飲食、心理平衡療法。合理膳食主要是指食用高蛋白、高熱量、高纖維素、易消化的食物，有利於肝臟的修復，但預防脂肪肝不必過分強調高營養；另外，在心理平衡方面，患者要樹立正確的疾病觀，對肝炎的治療要有足夠的信心和耐心，不要亂找醫生，以免耽誤治療。
肝纖維化是指肝瘢痕中纖維組織過度沈積，是纖維組織增生和纖維組織分解失衡的結果。纖維組織是身體對損傷的修復反應。壹旦有害因素被清除，纖維組織就會停止增生。
目前能抑制肝纖維組織增生的藥物主要有中藥:丹參、黃芪、桃仁、冬蟲夏草和中草藥。
幾乎所有的肝病都有炎癥性壞死，只要有炎癥性壞死，就會有肝組織的瘢痕纖維化。肝纖維化的不斷發展導致肝小葉結構的破壞和假小葉的形成，從而形成肝硬化。瘢痕纖維組織壓迫血管，引起門靜脈高壓和肝臟缺血，進壹步加重肝細胞的炎癥壞死，從而形成惡性循環。據此，要預防或延緩慢性肝炎的進展，除了積極有效地長期進行抗纖維化治療外，最重要的是盡可能地去除慢性病因，做到心平氣和。