科研方面，內分泌科有自己的實驗室。近年來，完成了上海市科委、上海市衛生局、復旦大學研究基金、閔行區科委等9個科研項目。在《中華內科雜誌》、《中華內分泌代謝雜誌》、《中華老年醫學雜誌》、《復旦大學學報》發表文章50余篇。主編出版專著1部，還參與臨床實驗診斷學的撰寫。二型糖尿病病壹級親屬脂聯素和頸動脈IMT5的臨床研究在國內首次開展，歷時5年。1994期間，內分泌科參與並完成了“全國糖尿病患病率調查”中上海市閔行區的抽樣調查。65438-0996內分泌科參與了中國、新加坡等國組成的“亞洲青年糖尿病五年跟蹤觀察”科研項目。2003年底成立糖尿病學校，每月舉辦壹次講座，為廣大糖尿病患者普及糖尿病相關知識。內分泌科還承擔著復旦大學醫學部、七年制臨床醫生、公共衛生系、皖南醫學院醫學部和成人教育系的實習教學和理論教學任務。內分泌科還積極參加上海廣播電臺組織的糖尿病講座。復旦大學附屬上海市第五人民醫院神經內科是醫院的重點專科之壹。目前擁有固定床位34張，其中重癥監護室6張，床位利用率>；100%。本科配備重癥監護系統、肌電圖、腦電圖、誘發電位、眼震電圖等固定設備和相應的醫技人員。本科對腦血管疾病、脊髓病、周圍神經病、癲癇、錐體外系疾病、肌肉疾病、各種顱內感染、頭痛頭暈等疾病的診治有豐富的經驗，並因成功治療危重疑難病例獲得上級部門的嘉獎。本科醫生除臨床工作外，承擔市、區、醫院多項科研項目，其中超早期腦梗死溶栓治療成功率高，達到市級先進水平。
神經內科原本是內科的專業組，治療神經內科常見病、多發病。2000年成為獨立病房，經過嚴格篩選，從其他醫院引進人才擔任學科帶頭人。專科得到較大發展，醫療業務、科研實力和教學工作上了壹個新臺階，得到了患者的認可。現在除了閔行及周邊地區的患者，還收治了很多其他省市地區的患者。
學院現已形成合理的人才梯隊，擁有高級職稱2名，主治醫師3名，1名主管技師，2名主管護士，3名住院醫師。腎內科成立於5月，1985。是上海西南郊最早的腎內科，是閔行衛生局的醫學特色專科。承擔著上海市西南郊包括閔行區、奉賢區、金山區、浙江省松江區和江蘇省鄰近縣的腎內科醫療任務，為該地區人民的健康做出了巨大貢獻。
目前，腎內科分為門診部、病房和血液透析室，年均普通門診4500余人次，專科門診4000余人次，專科門診2000余人次。尤其是專家門診出診力度大，顧勇教授、許教授等名醫坐鎮課堂，吸引了閔行及周邊地區的廣大腎友，從而使我科有了穩定的病源。病房床位25張，每年住院病人500余人，腎穿刺150例。血液透析患者90余人，年透析次數654.38+0萬余次。
慢性腎臟病的規範化診療是我們的專業之壹。病房主要治療原發性腎小球腎炎、腎病綜合征、間質性腎炎、腎小管疾病、各種繼發性腎小球疾病如狼瘡性腎炎、高血壓性腎病、糖尿病性腎病、痛風性腎病等。、尿路感染(包括急慢性腎盂腎炎和膀胱炎)、各種原因引起的急慢性腎功能衰竭、藥物和毒物中毒。我科是閔行區首家開展b超引導下經皮腎活檢的單位，目前已成為常規項目。利用b超引導下經皮腎穿刺活檢確定腎臟病理類型，不僅大大提高了我科的診療水平，而且為患者帶來了個體化治療的可能，確保了臨床-病理-治療模式的形成。
血液凈化治療是我科的另壹特色。早期在上海西南郊開展，規模大，設備先進，患者多，凈化手段齊全，技術水平高，患者生存質量好。透析室有20臺透析機，包括費森Yus 4008B、博朗和CRRT 1。我們的業務包括血液透析、血液濾過、連續腎臟替代療法(CRRT)和血液灌流。目前擁有二級防滲水處理系統，從源頭上保證了血液透析患者的生活質量。透析室為患者提供無微不至的治療和護理，配備彩電，為患者提供舒適溫馨的治療環境。CRRT技術發展至今，已涉及胸外科、普外科、呼吸內科、神經內科、ICU等多個學科，在醫院多學科間保障危重患者搶救中發揮了非常重要的作用。每年都通過了上海市衛生監督所的監測和上海市血液透析專業質量控制，對我們的透析水平和管理水平給予了很好的評價。腹膜透析(CAPD)是近年來開展的壹個項目。目前有20多名長期隨訪患者。
腎內科在保證完成臨床醫療任務的同時，註重人才梯隊的建設和培養。現有工作人員26人，醫生8人，護士18人，其中主任醫師(教授)3人，主治醫師2人，住院醫師3人。其中博士後2人，1碩士生2人。並擁有閔行區首屆科技之星1人。腎內科是我院第壹個培養復旦大學研究生的科室。現有博士生導師1人，研究生導師2人，在讀研究生8人。同時承擔復旦大學、上海醫學院、皖南醫學院、蚌埠醫學院的臨床教學任務。2002年，內科三級分後正式成立消化內科。隨著學科的發展，建立了強大的醫學技術隊伍和合理的人才梯隊，促進了醫學教學和科研的同步發展。
20世紀80年代，消化內科采用纖維內鏡診斷和治療胃腸道疾病。90年代，消化專業人員隊伍逐漸形成，他們從事內鏡技術的進修和培訓，積極參加國內和市內的各種消化學術交流活動，將新知識、新技術應用於臨床。胃鏡、腸鏡和十二指腸鏡的發展為消化系統疾病的診治開創了新局面。
消化內科成功搶救了許多消化系統的疑難危重病人，如肝硬化並發出血、肝昏迷、腦水腫、多器官功能衰竭、急性重癥胰腺炎、蛋白丟失性腸病、電解質紊亂、急性腎功能衰竭、休克、各種原因的消化道大出血等。消化內科開展了腹水回輸的工作，對各種原因的頑固性腹水的治療取得了良好的效果。胃腸起搏器已用於治療各種原因引起的胃腸動力障礙，效果良好。消化內科結合臨床開展了急診胃鏡檢查和治療，如食管靜脈曲張並發出血的硬化治療和圈套治療、異物取出、內鏡下支架置入和息肉切除、ERCP檢查、乳頭肌切開取石、支架置入等疑難診療，在上海市同級醫院中處於先進水平。
科室發表論文30余篇，其中科研項目“CagA基因菌株與胃十二指腸潰瘍的HP檢測”獲1998年閔行區科技成果二等獎。消化內科還在學院和地區壹級承擔了2個項目。心內科是壹個主要的內科。1979設立了獨立的心臟監護室(CCU病房，5張床位)，並在1999分為三個分院，使心臟病的診治專業化。至今已發展成為擁有9名專業醫生、30張床位，集教學、科研、臨床診療為壹體的綜合性學科。2003年被選為閔行區心血管內科專科學校。
心內科在五院成立較晚，但在內科的地位不容忽視。從上世紀50年代的郭守偉主任、70年代的於寶蓮主任、80、90年代的蔔國強主任、金松源主任、張主任，都在滬西南地區享有較高的醫療地位，曾聘請著名心血管專家蒲守月教授、何美賢教授為技術顧問，全面指導業務，吸引了各地患者。特別是2002年以來，在院長、副主任吳的帶領下，狠抓規範化診療，使心內科的整體業務素質和診療水平有了很大提高。與此同時，開展了許多新技術、新服務，診療病人成倍增長，危重病人搶救成功率達到95%以上。現已成為上海西南地區規模大、設備齊全、技術力量強的部門。
目前心內科設有CCU病房、普通病房、心導管室、無創功能檢查室、心電圖室等。現有心臟病專家9人，其中副主任醫師3人，主治醫師3人，住院醫師3人，碩士和在職碩士研究生5人，擁有西門子數字心血管影像機(DSA)、電腦化多道心電生理記錄儀(BARD)、惠普多中心心電監護系統等先進設備。每年治療500多名病人、5000多名門診病人和200多例手術。血液科是復旦大學附屬上海市第五人民醫院的特色專業，病房有22張床位，有獨立的血液實驗室。擅長骨髓瘤、淋巴瘤、骨髓增生異常綜合征、白血病、血小板減少性紫癜、過敏性紫癜、血友病、易栓癥、各種貧血、發熱等常見血液系統疾病的診治，在骨髓瘤、骨髓增生異常綜合征、白血病、血栓栓塞性疾病、出血性疾病的診治方面有壹定特色。
各部門註重國內外的聯系和溝通。在國際上，與日本廣島大學原子輻射醫學研究所、加拿大麥吉爾大學血液學系開展了國際交流與合作。上海與華山醫院、瑞金醫院、中山醫院、醫大壹院、新華醫院有著密切的溝通合作，與武漢同濟醫院、協和醫院、河南醫科大學附屬醫院、廣州醫學院附屬醫院有著廣泛的聯系。
劉現任主任，復旦大學上海醫學院教授，上海市首批“醫學院新星”之壹。曾赴日本廣島大學深造並擔任客座教授1年，臨床經驗豐富，學術意識強。血液科現有醫療技術人員17人，其中教授(主任醫師)3人，主治醫師3人，主管檢驗師2人，主管護士2人，初級人員7人，碩士研究生4人。面對老閔行區老年人口多於本市其他區縣同類人口的特點，住院難問題更加突出。在醫院各方面的重視和關心下，1997年4月成立了老年病科，同時以12病房的康復床位為基礎，重新整合了人才和衛生資源。2002年獲區科委項目“ⅳ期非小細胞肺癌聯合化療對比研究”三等獎，2003年獲“血管內皮生長因子與肺結核活動性研究”、“慢性阻塞性肺疾病合並腦梗死的臨床研究”、“老年住院患者焦慮和生活質量的相關調查研究”，並將進行區級鑒定和項目申報。多年來開展了高難度的經皮肝活檢、經皮肺活檢、經皮心包穿刺化療。通過努力，活躍了學術氛圍，提高了技術水平。自科室成立以來，已診斷疑難疾病10例，如肝肺綜合征、多發性硬化癥、漿液性積液等。在省級以上雜誌發表文章11篇。隨著雙水平呼吸機的應用，COPD合並呼吸衰竭的緩解率大大提高。
醫務人員17人，副主任醫師2人，主治醫師2人，住院醫師5人(含1碩士)，護士8人。設床位30張，年收治病人456人。先後開展了4個不同學科的專業門診。有1先進的雙水平呼吸機和心肺監護儀。全科醫療實行部分區域計算機管理。