尖銳濕疣多發生在年輕人身上。病程進展緩慢，多數患者無意中發現生殖器上有無痛性疣，平均潛伏期為3個月。
尖銳濕疣患者的皮損初期為微紅的小丘疹，後逐漸長大，表面有凹凸不平、柔軟的乳頭樣皮損，部分呈菜花狀，根部可有蒂，表面濕潤、汙灰。時間長的，表面可有糜爛滲出，有時會搔抓，可導致細菌感染，表面有膿性分泌物，有異味，疼痛。男性易發陰莖、龜頭、包皮、包皮系帶、腹股溝、肛門、直腸。陰莖疣通常發生在性交創傷的皮膚表面，尖銳濕疣也可發生在尿道，但多見於尿道口，偶爾發生在膀胱，尤其是包皮過長的患者。