1、領導、協調全國衛生行政部門、疾病預防控制機構和醫療機構做好流感大流行預防控制和醫療準備工作 (1)建立有效的工作機制、責任制和責任追究制； (2)制定應對流感大流行年度準備工作計劃； (3)加強流感監測工作和監測系統建設； (4)做好醫療救治和公***衛生幹預準備工作； (5)定期組織衛生部流感防治專家組分析、評估流感疫情，及時鑒定和評估新流感病毒。 (6)定期對準備工作落實情況進行督導檢查。
2、配合國務院有關部門，建立流感監測信息交流機制和渠道；***同加強疫苗生產能力準備，加強疫苗研發和生產；做好流感大流行藥品儲備和生產能力準備，加強抗流感病毒藥物研發和生產；積極開展流感預防控制技術科學研究；加強與國際組織的技術合作和交流。
3、及時公布有關流感監測信息，發出預警，提出相關措施建議。 在衛生部和各級衛生行政部門的統壹領導下，國家及各級疾病預防控制中心負責加強流感疫情監測預警系統的建設，提高監測系統質量。
1、監測系統建設 國家流感中心要建立符合生物安全要求的實驗室（包括高致病性禽流感病毒的實驗室）；建立國家流感毒株分子生物學信息庫；具備快速分離鑒定新、老毒株及變異株的技術；承擔全國流感病毒鑒定、分析、評估和對省級、地市級流感監測的技術咨詢和指導；提供足夠的標準化檢測試劑。 建立流感監測區域性中心，承擔鄰近省份流感監測技術指導工作，協助國家流感中心開展流感病毒株的抗原性和基因序列分析，協助國家流感中心做好全國流感監測技術培訓、指導和研究工作。 各省疾病預防控制中心要建立符合生物安全要求的、專用的流感實驗室；配備足夠的實驗室和流行病學專業人員；提高病毒分離、鑒定及抗原變異的分析能力、現場快速檢測能力；加強流感暴發流行病學調查和監測信息綜合分析能力。 市、縣疾病預防控制中心逐步建立符合生物安全要求的流感實驗室，加強現場快速檢測和病毒分離能力。 縣級以上衛生行政部門指定的醫療機構要按照疾病預防控制機構流感監測工作要求，配備專門人員負責流感監測工作，做好流感樣病例（體溫≥38℃，伴有咽痛或咳嗽癥狀之壹的病例）的采樣、標本的登記和送檢工作。 對需要審批認證的實驗室（如高致病性禽流感病毒操作所需P3實驗室），有關部門要加快審批進度。
2、監測工作內容 按照《全國流感、人禽流感監測實施方案》的規定和要求，各級疾病預防控制中心、醫療機構要認真做好流感病原學和流行病學監測、暴發疫情監測、人間禽流感應急監測工作。 醫療機構要按有關要求，采集流感樣病人標本，及時送流感實驗室進行病毒分離工作；疾病預防控制機構流感實驗室接到標本後，及時組織實驗室檢測和病毒分離，並報告結果。
3、報告 按照《傳染病防治法》、《突發公***衛生事件應急條例》等有關法律法規和《全國流感、人禽流感監測實施方案》等規範性文件的要求和規定進行報告。
4、信息交流 中國疾病預防控制中心負責利用全國傳染病疫情網絡直報技術平臺建立“全國流感、人禽流感監測信息管理系統”，對流感病原學和流行病學監測信息進行綜合管理。國家和省疾病預防控制中心要定期分析流感監測信息，建立周報制度，及時報告衛生部和省級衛生行政部門，及時反饋各地疾病預防控制中心和有關醫療機構。 衛生部負責協調與國務院有關部門建立流感監測信息交流和合作機制，及時互通流感監測相關信息。 與世界衛生組織保持信息溝通，及時收集分析全球流感監測信息。
5、新亞型流感病毒的確認 國內報告發現人類病例中分離出新亞型流感病毒，需國家流感中心和至少壹個流感分中心或壹個其它部門流感實驗室***同確認。 1、疫苗生產能力和潛力評估 有關部門開展對國內流感疫苗生產能力和潛力的調查和評估工作，為提高國內流感疫苗生產能力提供信息。
2、疫苗生產能力準備 有關部門制定流感疫苗生產研制國家扶持的相關政策，以提高生產廠家研制和生產流感疫苗的積極性；向公眾普及流感疫苗接種知識，擴大疫苗接種覆蓋率；重點支持流感疫苗開發、研制工作，發展多種類型和多種接種途徑（適合大面積使用）的疫苗；建立和健全疫苗質量管理體系，提高疫苗質量，降低疫苗生產成本，做好新亞型疫苗研發技術和生產能力的儲備。 有關部門完善流感疫苗研發、生產政策，建立有效的工作機制，以保證新型流感病毒疫苗及早供應。
3、疫苗使用優先人群 大流行期間的疫苗使用，優先考慮保護為社會提供基本服務的人群和老人、兒童等高危人群，降低流感新亞型的發病率和死亡率。 1、藥物儲備 衛生部負責擬定藥物儲備的品種和數量，報送國家有關部門負責儲備。藥物儲備和調用按照國家發改委《國家醫藥儲備應急預案》規定執行。
2、藥物生產能力和潛力的評估 有關部門開展對國內生產廠家抗流感病毒藥物生產能力和潛力調查和評估，為提高國內藥物生產能力提供信息。
3、藥物生產能力準備 有關部門組織制定抗流感病毒藥物生產國家扶持的相關政策，以提高生產廠家藥物研制和生產的積極性。開展預防和治療抗病毒藥物、中藥的科研工作。
4、藥物使用策略 抗流感病毒藥物優先用於臨床患者的治療，預防用藥優先使用人群包括老人、兒童、職業高危人群及患有慢性疾病免疫功能低下的人群等。 藥品使用和預防性用藥由疾病預防控制中心負責，治療性用藥由鄉鎮及以上醫療機構負責。藥物使用嚴格按照藥物使用說明書。 新聞發布會上，上海市疾控中心主任吳凡通報了上海的最新情況：截至2013年4月2日，沒有新增人感染H7N9禽流感病例，也無新報告不明原因肺炎病例。針對不明原因肺炎，上海市43個流感監測點和130家開設發熱門診的醫療機構從“每周報告”制度升級為“每日報告”制度。同時，切實發揮中小學校及托幼機構因病缺課缺勤網絡直報系統等作用，高度關註學校、醫院、養老院等集體單位1周內出現5例及以上有流行病學關聯的流感樣病例情況。上海46位與患者密切接觸者經過20天臨床醫學觀察，沒有發生感染癥狀和不適，當前已解除觀察。
農委副主任殷歐表示，這次病例發生後，已經對家禽進行全面排查，並未發現家禽感染病例。衛計委主任徐建光建議，無論是雞肉還是豬肉，都要煮熟了吃，不要生吃，盡量避免食用野禽。