1、生長環境不同：野生山慈菇通常生長在山間、森林、草地等自然環境中，而種植山慈菇則是在人工組織的溫度、濕度、光照等條件下生長。
2、外觀形態不同：野生山慈菇體型較小，外形成扇形或半扇形，顏色多為黑褐色或棕色。而種植山慈菇壹般生長較大，有肉質柄和扇形蓋，顏色鮮艷，多種顏色混合出現。
3、營養成分不同：野生山慈菇含有更多的天然營養成分，例如多種氨基酸、多糖、微量元素等，其中具有壹定的藥用價值。而種植山慈菇由於生長在人工環境下，其營養成分相對較少並且不壹定均衡。
4、價格不同：由於野生山慈菇數量有限且需要采集，價格相對較高。而種植山慈菇由於生產量大且比較容易供應，價格相對會便宜壹些。