衣原體在宿主體內生長繁殖，有兩種不同的顆粒結構原體和始體（網狀體）。原體是衣原體的胞外存在形式，與易感細胞表面的特異受體吸附後，通過攝粒作用進入胞內，形成吞噬小泡，原體在泡內胞壁變軟、增大形成網狀體，RNA增多。大約8小時後始體二分裂增殖，在細胞膜覆蓋的空泡內聚集，即稱為包涵體。網狀體濃縮形成具有堅韌細胞壁的原體，最後細胞破裂釋放原體，再感染其他細胞。網狀體在胞外不能存活，無感染性。