新疆自治區三甲醫院特別多，“三甲”雖然兩個字，實際代表兩個標準，“三”代表三級，“甲”代表三級中最高級別的醫院，全稱叫三級甲等醫學院，簡稱三甲醫院，這是依照《醫院分級管理辦法》等的規定劃分的醫療機構級別。新疆自治區三甲醫院有以下幾家，都是公辦醫院，不在每個都添加解釋了
01、新疆維吾爾自治區人民醫院，這是新疆老牌醫院，無論是在烏魯木齊，還是在新疆其他地方，這所醫院的名氣都非常大。醫院地址：新疆烏魯木齊市天山區天池路91號
02、新疆醫科大學第壹附屬醫院，這是新疆醫科大學的附屬醫院，而新疆醫科大學是“壹五計劃”大項目，這家醫院也隨之誕生，在新疆名氣也非常大。醫院地址：新疆維吾爾自治區烏魯木齊市新市區鯉魚山南路137號。
03、烏魯木齊市口腔醫院，口腔專科醫院，醫院地址：新疆烏魯木齊市中山路147號
04、烏魯木齊市友誼醫院（烏魯木齊市第三醫院），醫院地址：新疆維吾爾自治區烏魯木齊市勝利路558號
05、新疆醫科大學第五附屬醫院（烏魯木齊鐵路局中心醫院），醫院地址：新疆維吾爾自治區烏魯木齊市新市區河南路118號
06、新疆維吾爾自治區腫瘤醫院，醫院地址：新疆維吾爾自治區烏魯木齊市新市區蘇州東街789號
07、新疆心腦血管病醫院，醫院地址：新疆烏魯木齊市高新街南3巷45號
08、新疆醫科大學附屬腫瘤醫院，醫院地址：新疆維吾爾自治區烏魯木齊市新市區北京南路30號
09、中國人民解放軍第四七四醫院。
10、石河子大學醫學院第壹附屬醫院，醫院地址：新疆石河子市北二路32小區
11、新疆自治區人民醫院，醫院地址：新疆維吾爾自治區烏魯木齊市天山區天池路91號
12、新疆生產建設兵團總醫院（石沙子大學醫學院第二附屬醫院），醫院地址：新疆烏魯木齊市天山區青年路232號
13、新疆醫科大學第二附屬醫院，醫院地址：新疆維吾爾自治區烏魯木齊市七道灣路50號
14、克拉馬依市中心醫院，醫院地址：新疆維吾爾自治區克拉瑪依市準噶爾路67號
15、中國人民解放軍蘭州軍區烏魯木齊總醫院。
16、新疆伊犁哈薩克自治州友誼醫院，醫院地址：新疆維吾爾自治區伊犁地區伊寧市斯大林街92號
17、新疆醫科大第壹附屬醫院，醫院地址：新疆烏魯木齊市鯉魚山路l號
18、新疆創傷外科醫院，醫院地址：新疆維吾爾自治區烏魯木齊市七道灣路50號
19、新疆醫科大學第二附屬醫院七道灣醫院（新疆醫科大學第二附屬醫院老院），醫院地址：新疆維吾爾自治區烏魯木齊市水磨溝區七道灣路50號
20、克拉瑪依市中心醫院，醫院地址：新疆克拉瑪依市克拉瑪依區準噶爾路67號
21、伊犁哈薩克自治州友誼醫院，醫院地址：新疆伊犁州伊寧縣斯大林街92號
22、wujing新疆生產建設兵團指揮部醫院。
23、新疆維吾爾自治區中醫醫院，醫院地址：新疆烏魯木齊市黃河路53號