亳州市人民醫院***分兩個院區，即新院區和北院區。新院區包括以前投入使用的南院區和剛剛運行的新院區；北院區即老院區。全院科室具體分布如下 ：
北院區：
婦產科大樓： 1F：婦科 2F：產科 3F：新生兒重癥監護室 4F：產科貴賓服務壹區 5F：產科貴賓服務二區 6F：產房 7F：手術室
兒科大樓： 1F：ICU 影像中心 2F：普外二科 檢驗科 3F：小兒科三病區 康復科 4F：小兒科壹病區 小兒科二病區
門診樓： 1F：內科、外科門診 2F：專家門診 婦科門診 3F：兒科門診
院外北樓： 1F：中西醫內科 2F：精神病科
新院區：
1號樓： 1F：住院收費 2F：住院藥房 3F：血液凈化中心 4F：ICU 手術室 5F：泌尿外科 6F：骨科壹病區（關節外科） 7F：骨科二病區（脊柱外科） 8F：骨科三病區 （小兒骨手足外科） 9F ：普外科壹病區（肝膽外科） 10F：普外科三病區（肛腸胃腸外科） 11F：普外科六病區（甲乳血管外科） 12F：神經外科 13F ：心內科壹病區 14F ：心內科二病區 15F ：心胸外科 16F ：耳鼻喉科 燒傷整形科 17F ：眼科 口腔科 18F ：內分泌科 19F ：消化內科
2號樓： 1F：緊急救援中心 2F：腫瘤科壹病區 3F：神經內科二病區 4F：腫瘤科二病區 5F：神經內科壹病區 6F：神經內科三病區
3號樓： 1F：針灸理療科 2F：感染科 3F：呼吸內科壹病區
4F：呼吸內科二病區 5F：腎內科 6F：血液科
門診樓： 1F：急診科 輸液大廳 針灸理療科 2F：內科門診 外科門診 3F：五官門診 職能科室 4F：體檢中心 職能科室
醫技樓： 1F：影像中心 消毒供應中心 2F：超聲醫學中心 內鏡中心 3F：檢驗科 病理科